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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 求助--Openmpi-1.8集群编译问题
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板桥霜

木虫 (正式写手)
内容已删除
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11楼2014-04-27 23:06:38
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mywai520

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
11楼: Originally posted by 板桥霜 at 2014-04-27 23:06:38
大侠，您好说的我知道，几个软件都提供并行环境，但是参数还是有区别的吧？谢谢
...

那好吧，编译的参数没有区别。你都编译成功了，且能单机运行就说明没有问题。现在你是不能两台机器并行，不是的mpi的问题。

还有mpi编译这个问题是个简单问题，指定环境变量即可。任何软件的编译基本上都没有区别。

你是要如何实现两台机器并行，而不是在纠正我编译的参数有么有问题。

我可以明确告诉你，你的参数没有什么问题。
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12楼2014-04-27 23:09:54
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mywai520

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

动态库跟静态库调用的问题。
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13楼2014-04-27 23:11:46
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板桥霜

木虫 (正式写手)
引用回帖:
12楼: Originally posted by mywai520 at 2014-04-27 23:09:54
那好吧，编译的参数没有区别。你都编译成功了，且能单机运行就说明没有问题。现在你是不能两台机器并行，不是的mpi的问题。

还有mpi编译这个问题是个简单问题，指定环境变量即可。任何软件的编译基本上都没有区 ...

谢谢大侠指导，那么我现在mpi编译没有问题的话，为何我在hostfile里面制定了节点信息后无法正确运行测试文件hello_c呢？问题应该出现在哪儿呢，请大侠赐教，谢谢
！
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14楼2014-04-28 00:25:12
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chuanghua304

禁虫 (职业作家)
本帖内容被屏蔽
15楼2014-04-28 07:28:35
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chuanghua304

禁虫 (职业作家)
本帖内容被屏蔽
16楼2014-04-28 07:43:43
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mywai520

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

icpc没有，是c++编译器。
你的错误出现是没有找到mpirun,也就是说的mpi没有加入环境变量中。要么在.bash下加入mpi运行路径以其库函数的路劲，要么在/etc/profile里已经设定了PATH以及LD_LIBRARY_PATH。

但是这个问题有时候必须在重新在~/.bashrc里重新设置PATH以及LD_LIBRARY_PATH后，才可以正常运行。

还有，我仔细看了一下说明书，运行是不是应该如下命令，举个例子：
mpirun -hostfile hosts -np 2 ./a.out
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17楼2014-04-28 08:53:21
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板桥霜

木虫 (正式写手)
引用回帖:
17楼: Originally posted by mywai520 at 2014-04-28 08:53:21
icpc没有，是c++编译器。
你的错误出现是没有找到mpirun,也就是说的mpi没有加入环境变量中。要么在.bash下加入mpi运行路径以其库函数的路劲，要么在/etc/profile里已经设定了PATH以及LD_LIBRARY_PATH。

但是这个 ...

感谢大侠帮忙，我看了看说明书，有以下问题：
1：关于icpc，说明书上还是在哪儿看过一次，说是intel编译器早期版本用icc，后来变成了icpc，我想这里用icpc应该是对的。。。。
2：我已经在/root/.bash_profile和/etc/profile中添加环境变量，reboot后which mpirun
/usr/local/openmpi-1.8/bin/miprun
3：我用您给的命令格式运行了一下，依然提示错误。说明书中说的好像hostfile默认就是..../openmpi-1.8/etc/openmpi-default-hosts
已经弄了快一个月了，大侠帮忙啊
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18楼2014-04-28 09:45:22
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mywai520

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
18楼: Originally posted by 板桥霜 at 2014-04-28 09:45:22
感谢大侠帮忙，我看了看说明书，有以下问题：
1：关于icpc，说明书上还是在哪儿看过一次，说是intel编译器早期版本用icc，后来变成了icpc，我想这里用icpc应该是对的。。。。
2：我已经在/root/.bash_profile和/ ...

一个问题：
运行mpi你是在root用户下，而不是别的用户？
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19楼2014-04-28 10:03:56
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板桥霜

木虫 (正式写手)
引用回帖:
19楼: Originally posted by mywai520 at 2014-04-28 10:03:56
一个问题：
运行mpi你是在root用户下，而不是别的用户？...

是的，都是在root用户下
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20楼2014-04-28 10:27:03
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