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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 求助--Openmpi-1.8集群编译问题
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板桥霜

木虫 (正式写手)

[求助] 求助--Openmpi-1.8集群编译问题 已有2人参与

各位大侠，本人纯属菜鸟，最近出于好奇，爱好，兴趣。。。。。搞了几台台古董，想自己搭建集群，怎奈基础不牢，从开始到现在快两个周了，还没有成功，废话不多说，上问题，忘各位不吝赐教。
硬件环境：1台浪潮服务器：2个CPU，两核，Intel Xeon 2.4GHz. 2台并行机，1个CPU，Pentium D 3.4GHz，1000M交换机。
软件：redhat linux 6.2，Intel l_fcompcxe_2013_sp1.2.144 & l_ccompcxe_3013_sp1.2.144, Openmpi-1.8，目标是并行编译安装vasp5.2，实现并行运算。
目前进行到单机并行编译VASP，运算没有问题，但是无法实现集群并行运算。我感觉问题出现在Openmpi上，经过我自己的测试，编译Openmpi用以下指令：
./configure --prefix=/usr/local/openmpi-1.8 FC=/opt/intel/bin/ifort CC=/opt/intel/bin/icc CXX=/opt/intel/bin/cipc
make
make install
后测试运行hello_c
结果：
hello, world, I am 0 of 2,.....
hello, world, I am 1 of 2,....
如果修改openmpi-default-hostfile添加各节点；
LAB-P1 slots=1
LAB-P2 slots=2
运行测试
mpirun hello_c
得到结果如下：
bash: orted: command not found
bash: orted: command not found
请问各位大侠，是我的openmpi 没有编译对吗？如果是，问题出在哪？我该怎么做？如果不是又该怎么处理呢？
谢谢！
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1楼 2014-04-27 18:57:23
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mywai520

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
问一句，你的两台机器做了共享NFS服务否，还有吉他相关集群设置问题。可以参考一下我以前做搭建做的一些笔记:
http://vasp1860.blog.edu.cn/home ... g&id=159741
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2楼2014-04-27 20:48:58
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板桥霜

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by mywai520 at 2014-04-27 20:48:58
问一句，你的两台机器做了共享NFS服务否，还有吉他相关集群设置问题。可以参考一下我以前做搭建做的一些笔记:
http://vasp1860.blog.edu.cn/home.php?mod=space&uid=1556291&do=blog&id=159741...

作了共享了，我先学习下

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3楼2014-04-27 21:49:37
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板桥霜

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by mywai520 at 2014-04-27 20:48:58
问一句，你的两台机器做了共享NFS服务否，还有吉他相关集群设置问题。可以参考一下我以前做搭建做的一些笔记:
http://vasp1860.blog.edu.cn/home.php?mod=space&uid=1556291&do=blog&id=159741...

大侠，你是用的mpi﹉

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4楼2014-04-27 21:55:20
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mywai520

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

不用mpi怎么并行，不过那已经是很多年前做的集群。
若是你现在要做集群，建议你用rocks，这样可以省很多事情。
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5楼2014-04-27 21:59:38
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板桥霜

木虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by mywai520 at 2014-04-27 21:59:38
不用mpi怎么并行，不过那已经是很多年前做的集群。
若是你现在要做集群，建议你用rocks，这样可以省很多事情。

mpi和openmpi不一样吧 大侠多指教

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6楼2014-04-27 22:18:11
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mywai520

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 板桥霜 at 2014-04-27 22:18:11
mpi和openmpi不一样吧 大侠多指教
...

mpi并行软件有几种：mpich2 mpich  openmpi  intel-mpi  Hp-mpi
但是基本都是一样，只是开发者不同而已。现在多用openmpi，因为是开源的。但是跟mipch或者mpich2区别不大，其实根本就没有区别。都是mpi,用来做并行计算的代码。

你现在的问题，不是集群装个MPI就能并行了。需要设置磁盘共享，网络共享，数据同步等相关服务。装mpi只是给你提供一个并行服务，并不能在没有前面相关支持下就能两台不相干的机器就能并行。
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7楼2014-04-27 22:26:12
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chuanghua304

禁虫 (职业作家)
本帖内容被屏蔽
8楼2014-04-27 22:31:17
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mywai520

铁杆木虫 (著名写手)
集群不是装一个openmpi就是集群，就能并行！！！！！
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9楼2014-04-27 22:48:31
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板桥霜

木虫 (正式写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by chuanghua304 at 2014-04-27 22:31:17
./configure CC=icc CXX=icpc F77=ifort FC=ifort --prefix=/opt/openmpi --enable-static  用这个编译openmpi

生成动态和静态库有何区别？

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10楼2014-04-27 23:04:28
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