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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 求助--Openmpi-1.8集群编译问题
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mywai520

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
20楼: Originally posted by 板桥霜 at 2014-04-28 10:27:03
是的，都是在root用户下...

你在计算的当前目录下建立一个hosts,里面内容按说明书来。
然后运行试一试：mpirun -hostfile ./hosts -np 2 ./a.out
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21楼2014-04-28 10:37:01
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板桥霜

木虫 (正式写手)
引用回帖:
21楼: Originally posted by mywai520 at 2014-04-28 10:37:01
你在计算的当前目录下建立一个hosts,里面内容按说明书来。
然后运行试一试：mpirun -hostfile ./hosts -np 2 ./a.out...

您好，我在计算目录下进行如下操作：
#vi hosts
LAB-P1 slots=1
LAB-P2 slots=2
:wq
mpirun --hostfile ./hosts -np 2 hello_c ./a.out
提示：
bash: orted: command not found
bash: orted: command not found

您有其他联系方式吗，方便加我吗？谢谢
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22楼2014-04-28 10:44:11
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mywai520

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
22楼: Originally posted by 板桥霜 at 2014-04-28 10:44:11
您好，我在计算目录下进行如下操作：
#vi hosts
LAB-P1 slots=1
LAB-P2 slots=2
:wq
mpirun --hostfile ./hosts -np 2 hello_c ./a.out
提示：
bash: orted: command not found
bash: orted: command not  ...

同样错误说明还是没有找到mpirun
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23楼2014-04-28 11:01:20
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mywai520

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

直接 指定运行路劲试一试，你的幻境变量总是不对啊

/usr/local/openmpi-1.8/bin/miprun -np  .........................
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24楼2014-04-28 11:02:24
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板桥霜

木虫 (正式写手)
引用回帖:
23楼: Originally posted by mywai520 at 2014-04-28 11:01:20
同样错误说明还是没有找到mpirun...

您好，现在我在默认的hostfiles里面不指定节点，（说明里面说是单机运行），则：
mpirun hello_c ./a.out
hello world I am 0 of 2
hello world I am 1 of 2
说明单机情况下可以找到mpirun
多机并行找不到？
可以这样理解吗
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25楼2014-04-28 11:05:21
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mywai520

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
25楼: Originally posted by 板桥霜 at 2014-04-28 11:05:21
您好，现在我在默认的hostfiles里面不指定节点，（说明里面说是单机运行），则：
mpirun hello_c ./a.out
hello world I am 0 of 2
hello world I am 1 of 2
说明单机情况下可以找到mpirun
多机并行找不到？
...

第二台机器上是否能找到？你是否在第二台机器上也安装了mpi，若是没有肯定找不到
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26楼2014-04-28 11:13:52
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mywai520

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

共享是不会共享根目录吧，一般都是共享home目录
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27楼2014-04-28 11:14:27
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板桥霜

木虫 (正式写手)
引用回帖:
24楼: Originally posted by mywai520 at 2014-04-28 11:02:24
直接 指定运行路劲试一试，你的幻境变量总是不对啊

/usr/local/openmpi-1.8/bin/miprun -np  .........................

您好，我直接指定的目录
/usr/local/openmpi-1.8/bin/ mpirun hello_c
提示：
erro while loading shared libraries: libsvml.so: cannnot open shared object file: No such file or directory
可我在环境变量LD_LIBRARY_PATH里面已经添加了路径了啊
到底怎么回事儿，请大侠帮忙分析，谢谢
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28楼2014-04-28 11:16:26
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板桥霜

木虫 (正式写手)
引用回帖:
26楼: Originally posted by mywai520 at 2014-04-28 11:13:52
第二台机器上是否能找到？你是否在第二台机器上也安装了mpi，若是没有肯定找不到...

三台机器都安装了mpi，问题可能出现在共享上面，我现在的情况需要共享那个目录呢？是/usr还是他下面的local？谢谢
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29楼2014-04-28 11:19:14
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mywai520

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
28楼: Originally posted by 板桥霜 at 2014-04-28 11:16:26
您好，我直接指定的目录
/usr/local/openmpi-1.8/bin/ mpirun hello_c
提示：
erro while loading shared libraries: libsvml.so: cannnot open shared object file: No such file or directory
可我在环境变 ...

看来还是环境变量的问题，没有找到这个文件。

你是以找找：
# updatedb
# locate  libsvml.so
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30楼2014-04-28 11:33:02
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