24小时热门版块排行榜    

查看: 3300  |  回复: 37
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

板桥霜

木虫 (正式写手)

[求助] 求助--Openmpi-1.8集群编译问题 已有2人参与

各位大侠,本人纯属菜鸟,最近出于好奇,爱好,兴趣。。。。。搞了几台台古董,想自己搭建集群,怎奈基础不牢,从开始到现在快两个周了,还没有成功,废话不多说,上问题,忘各位不吝赐教。
硬件环境:1台浪潮服务器:2个CPU,两核,Intel Xeon 2.4GHz. 2台并行机,1个CPU,Pentium D 3.4GHz,1000M交换机。
软件:redhat linux 6.2,Intel l_fcompcxe_2013_sp1.2.144 & l_ccompcxe_3013_sp1.2.144, Openmpi-1.8,目标是并行编译安装vasp5.2,实现并行运算。
目前进行到单机并行编译VASP,运算没有问题,但是无法实现集群并行运算。我感觉问题出现在Openmpi上,经过我自己的测试,编译Openmpi用以下指令:
./configure --prefix=/usr/local/openmpi-1.8 FC=/opt/intel/bin/ifort CC=/opt/intel/bin/icc CXX=/opt/intel/bin/cipc
make
make install
后测试运行hello_c
结果:
hello, world, I am 0 of 2,.....
hello, world, I am 1 of 2,....
如果修改openmpi-default-hostfile添加各节点;
LAB-P1 slots=1
LAB-P2 slots=2
运行测试
mpirun hello_c
得到结果如下:
bash: orted: command not found
bash: orted: command not found
请问各位大侠,是我的openmpi 没有编译对吗?如果是,问题出在哪?我该怎么做?如果不是又该怎么处理呢?
谢谢!
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

板桥霜

木虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by mywai520 at 2014-04-27 21:59:38
不用mpi怎么并行,不过那已经是很多年前做的集群。
若是你现在要做集群,建议你用rocks,这样可以省很多事情。

mpi和openmpi不一样吧 大侠多指教

[ 发自小木虫客户端 ]
6楼2014-04-27 22:18:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 38 个回答

mywai520

铁杆木虫 (著名写手)


【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
问一句,你的两台机器做了共享NFS服务否,还有吉他相关集群设置问题。可以参考一下我以前做搭建做的一些笔记:
http://vasp1860.blog.edu.cn/home ... g&id=159741
2楼2014-04-27 20:48:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

板桥霜

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by mywai520 at 2014-04-27 20:48:58
问一句,你的两台机器做了共享NFS服务否,还有吉他相关集群设置问题。可以参考一下我以前做搭建做的一些笔记:
http://vasp1860.blog.edu.cn/home.php?mod=space&uid=1556291&do=blog&id=159741...

作了共享了,我先学习下

[ 发自小木虫客户端 ]
3楼2014-04-27 21:49:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

板桥霜

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by mywai520 at 2014-04-27 20:48:58
问一句,你的两台机器做了共享NFS服务否,还有吉他相关集群设置问题。可以参考一下我以前做搭建做的一些笔记:
http://vasp1860.blog.edu.cn/home.php?mod=space&uid=1556291&do=blog&id=159741...

大侠,你是用的mpi﹉

[ 发自小木虫客户端 ]
4楼2014-04-27 21:55:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 综述论文作为代表作会不会影响评审专家的印象分? +11 yufeiwaner 2026-08-09 12/600 2026-08-12 01:27 by 南京中西医
[基金申请] 奇怪,两个人的filecode固定段从头到尾一模一样 +7 布布和一二 2026-08-10 9/450 2026-08-11 22:12 by 医学老男孩
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果? +3 yuleib84 2026-08-11 3/150 2026-08-11 21:53 by jnhyjjm
[基金申请] 有时候,自然基金真的不能太认真 (我的申报经验) +3 majunge000 2026-08-11 4/200 2026-08-11 20:13 by lch2012
[基金申请] 帮忙看看fileCode +7 wwncly 2026-08-10 13/650 2026-08-11 19:36 by 冰心玉壶晴
[基金申请] 分享一下我之前已中青C的计划书的filecode +3 布布和一二 2026-08-11 4/200 2026-08-11 15:20 by aasahr
[论文投稿] 职称评审,求友友推荐见刊最快的期刊 +3 工厂打螺丝 2026-08-08 3/150 2026-08-11 13:42 by 会议编辑
[基金申请] 听说今天filecode变了 +26 布布和一二 2026-08-06 49/2450 2026-08-11 13:18 by WH3796
[基金申请] FileCode能看出啥? +7 要乐观耀哥 2026-08-10 17/850 2026-08-11 10:50 by 要乐观耀哥
[基金申请] 我的国基提前知道中了,可是同事的操作让我实在接受不了,怎么会有这样的人 +8 家与远方 2026-08-10 13/650 2026-08-11 09:49 by 家与远方
[基金申请] 确定了,国自然21号放榜 +6 布布和一二 2026-08-10 7/350 2026-08-10 19:15 by 2000zf36392
[基金申请] 静等基金结果 +5 gjjjzhong 2026-08-10 16/800 2026-08-10 17:19 by Tide man
[基金申请] 国自然结果 +4 Vierhys 2026-08-10 8/400 2026-08-10 15:06 by Vierhys
[基金申请] filecode与中标关系的预测 +5 布布和一二 2026-08-07 5/250 2026-08-09 16:15 by 袁向阳007
[基金申请] 关于豆爷回答的JTJC与%2F数量 +5 yang182083 2026-08-06 7/350 2026-08-08 18:29 by zhanghaozhu
[基金申请] 关于filecode +4 布布和一二 2026-08-07 7/350 2026-08-07 22:55 by zhanghaozhu
[基金申请] 固定端突然变了,今天 +6 archvillain 2026-08-06 10/500 2026-08-07 16:03 by 医学老男孩
[基金申请] filecode变化情况 +6 布布和一二 2026-08-07 22/1100 2026-08-07 14:45 by 且听虎啸
[基金申请] filecode +14 等待解的谜 2026-08-06 19/950 2026-08-07 12:20 by wlwhappy
[基金申请] 影响面上的因素 +8 布布和一二 2026-08-05 11/550 2026-08-06 10:41 by 宝贝虫子
信息提示
请填处理意见