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板桥霜木虫 (正式写手)
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[求助]
求助--Openmpi-1.8集群编译问题 已有2人参与
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各位大侠，本人纯属菜鸟，最近出于好奇，爱好，兴趣。。。。。搞了几台台古董，想自己搭建集群，怎奈基础不牢，从开始到现在快两个周了，还没有成功，废话不多说，上问题，忘各位不吝赐教。 硬件环境：1台浪潮服务器：2个CPU，两核，Intel Xeon 2.4GHz. 2台并行机，1个CPU，Pentium D 3.4GHz，1000M交换机。 软件：redhat linux 6.2，Intel l_fcompcxe_2013_sp1.2.144 & l_ccompcxe_3013_sp1.2.144, Openmpi-1.8，目标是并行编译安装vasp5.2，实现并行运算。 目前进行到单机并行编译VASP，运算没有问题，但是无法实现集群并行运算。我感觉问题出现在Openmpi上，经过我自己的测试，编译Openmpi用以下指令： ./configure --prefix=/usr/local/openmpi-1.8 FC=/opt/intel/bin/ifort CC=/opt/intel/bin/icc CXX=/opt/intel/bin/cipc make make install 后测试运行hello_c 结果： hello, world, I am 0 of 2,..... hello, world, I am 1 of 2,.... 如果修改openmpi-default-hostfile添加各节点； LAB-P1 slots=1 LAB-P2 slots=2 运行测试 mpirun hello_c 得到结果如下： bash: orted: command not found bash: orted: command not found 请问各位大侠，是我的openmpi 没有编译对吗？如果是，问题出在哪？我该怎么做？如果不是又该怎么处理呢？ 谢谢！ |
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板桥霜
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感谢大侠帮忙，我看了看说明书，有以下问题： 1：关于icpc，说明书上还是在哪儿看过一次，说是intel编译器早期版本用icc，后来变成了icpc，我想这里用icpc应该是对的。。。。 2：我已经在/root/.bash_profile和/etc/profile中添加环境变量，reboot后which mpirun /usr/local/openmpi-1.8/bin/miprun 3：我用您给的命令格式运行了一下，依然提示错误。说明书中说的好像hostfile默认就是..../openmpi-1.8/etc/openmpi-default-hosts 已经弄了快一个月了，大侠帮忙啊 |
18楼2014-04-28 09:45:22
mywai520
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【答案】应助回帖
感谢参与，应助指数 +1
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问一句，你的两台机器做了共享NFS服务否，还有吉他相关集群设置问题。可以参考一下我以前做搭建做的一些笔记: http://vasp1860.blog.edu.cn/home ... g&id=159741 |
2楼2014-04-27 20:48:58
板桥霜
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3楼2014-04-27 21:49:37
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4楼2014-04-27 21:55:20