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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 培养/筛选 » 真菌18S 鉴定中系统发育树建立
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wmhye

金虫 (小有名气)

[求助] 真菌18S 鉴定中系统发育树建立 已有1人参与

分离出的菌应该是红曲霉，但是建立系统发育树的时候为什么出现这种情况，求指导。。。M1是需鉴定的菌

真菌18S 鉴定中系统发育树建立
图片1.png
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爱海洋，更爱生物
1楼 2015-04-02 15:17:38
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王贤卓

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
wmhye: 金币+10 2015-04-03 23:06:08
鉴定一株真菌时，一般选取十个参照序列。其中可选取几个属内不同种的参考序列，再选取不同属的参考序列。看看别人建树，你就能清楚了解到。
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2楼2015-04-03 15:13:23
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王贤卓

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

工选取十个左右的参考序列
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3楼2015-04-03 15:13:48
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wmhye

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 王贤卓 at 2015-04-03 15:13:23
鉴定一株真菌时，一般选取十个参照序列。其中可选取几个属内不同种的参考序列，再选取不同属的参考序列。看看别人建树，你就能清楚了解到。

恩。。。我又重新选了一些菌，这下有分支了
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爱海洋，更爱生物
4楼2015-04-03 23:06:40
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看见自己

铁杆木虫 (知名作家)
引用回帖:
4楼: Originally posted by wmhye at 2015-04-03 23:06:40
恩。。。我又重新选了一些菌，这下有分支了...

你是咋选的那些菌呢？我现在一头雾水！
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5楼2015-04-13 17:36:40
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wmhye

金虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 看见自己 at 2015-04-13 17:36:40
你是咋选的那些菌呢？我现在一头雾水！...

直接去NCBI里面比对，从比对结果中挑一些序列，或者直接输入你那个菌的名字，在ncbi的GENbank里面找一些序列，然后再找一些模式菌株就好了
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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

看见自己
爱海洋，更爱生物
6楼2015-04-17 10:57:56
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看见自己

铁杆木虫 (知名作家)
送红花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by wmhye at 2015-04-17 10:57:56
直接去NCBI里面比对，从比对结果中挑一些序列，或者直接输入你那个菌的名字，在ncbi的GENbank里面找一些序列，然后再找一些模式菌株就好了...

谢谢你

[ 发自小木虫客户端 ]
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7楼2015-04-17 12:24:21
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gwy6255

新虫 (小有名气)
你好，想请教你个问题，可以吗？

发自小木虫Android客户端
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8楼2017-08-29 09:46:09
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