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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » NBO/AIM » NBO分析后看分子轨道图的错误。
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molx79

新虫 (初入文坛)

[求助] NBO分析后看分子轨道图的错误。 已有1人参与

目前遇到的难题
1、用高斯计算NBO，输入文件如下：
%chk=H2NCHO-HF-321-nbo.chk
#rhf/3-21g   pop=(NBOread,savenbo)

RHF/3-21G for formamide (H2NCHO)

0 1
  H  -1.908544      0.420906     0.000111
  H  -1.188060     -1.161135     0.000063
  N  -1.084526     -0.157315     0.000032
  C    0.163001      0.386691    -0.000154
  O   1.196265      -0.246372     0.000051
  H    0.140159      1.492269     0.000126

$NBO bndidx $END
2、得到chk文件后转换成fch文件
3、用GV打开fch文件：
results----surfaces/contours----cubes Available ----cube Actions---molecular Orbital如图所示
Surfaces Available ----new  surfaces  就会出现图2.但是应该的结果是图三。

NBO分析后看分子轨道图的错误。
2.JPG


NBO分析后看分子轨道图的错误。-1
3.JPG


NBO分析后看分子轨道图的错误。-2
123.JPG
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1楼 2015-03-29 16:10:15
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不取俗名

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

输入文件有问题，去看sob的帖子，有详细说怎么看nbo轨道的

发自小木虫Android客户端
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4楼2016-04-11 13:44:16
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molx79

新虫 (初入文坛)
应该得到最后的图，但是为什么老是得到第二张图，哪里出错了，拜托大家赐教。这是第一个占据轨道的输出文件：
1. (1.99310) BD ( 1) H   1 - N   3  
                ( 29.05%)   0.5390* H   1 s(100.00%)
                                           -1.0000 -0.0010
                ( 70.95%)   0.8423* N   3 s( 30.92%)p 2.23( 69.08%)
                                            0.0002 -0.5561 -0.0020  0.6880  0.0155
                                           -0.4660  0.0088 -0.0001  0.0000。
应该是西格玛键，但是GV看图第一个轨道怎么在O5原子上。用Multiwfn看也是如此，不知道错在哪里了
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2楼2015-03-29 16:14:21
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ZHOUQIAOQIAO

金虫 (初入文坛)

超级玛丽
请问 您是用gaussian03 直接计算的吗？？？
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加油！
3楼2016-04-07 09:38:34
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