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molx79

新虫 (初入文坛)

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[求助] NBO分析后看分子轨道图的错误。已有1人参与

目前遇到的难题
1、用高斯计算NBO，输入文件如下：
%chk=H2NCHO-HF-321-nbo.chk
#rhf/3-21g pop=(NBOread,savenbo)

RHF/3-21G for formamide (H2NCHO)

0 1
  H  -1.908544    0.420906    0.000111
  H  -1.188060    -1.161135    0.000063
  N  -1.084526    -0.157315    0.000032
  C 0.163001    0.386691 -0.000154
  O 1.196265    -0.246372    0.000051
  H 0.140159    1.492269    0.000126

$NBO bndidx $END
2、得到chk文件后转换成fch文件
3、用GV打开fch文件：
results----surfaces/contours----cubes Available ----cube Actions---molecular Orbital如图所示
Surfaces Available ----new  surfaces  就会出现图2.但是应该的结果是图三。

2.JPG

3.JPG

123.JPG

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1楼2015-03-29 16:10:15

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molx79

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应该得到最后的图，但是为什么老是得到第二张图，哪里出错了，拜托大家赐教。这是第一个占据轨道的输出文件：
1. (1.99310) BD ( 1) H 1 - N 3
            ( 29.05%) 0.5390* H 1 s(100.00%)
                                       -1.0000 -0.0010
            ( 70.95%) 0.8423* N 3 s( 30.92%)p 2.23( 69.08%)
                                          0.0002 -0.5561 -0.0020  0.6880  0.0155
                                       -0.4660  0.0088 -0.0001  0.0000。
应该是西格玛键，但是GV看图第一个轨道怎么在O5原子上。用Multiwfn看也是如此，不知道错在哪里了