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byqmoney实习版主
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转录组数据上传至GEO的问题，请会的大侠帮帮我 已有3人参与
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前段时间我上传了转录组数据，raw data 和 processed data文件夹的内容 如下图，但是GEO回复邮件说是少传了一些数据，我现在不清楚我具体还需要上传什么？帮我看看还需要上传哪些，其中公司给我的数据的目录见后面的图。另外GEO给我的邮件我黏贴上来，哪位大侠帮帮我，小妹不甚感激啊。GEO的邮件内容： Thank you for your recent submission to GEO. Before we can process your submission there are some issues to address. Please provide files containing *quantitative* data for your 4 samples. For example: * raw counts for each transcript, and/or * normalized abundance measurements for each transcript, e.g., output from Cufflinks, Cuffdiff, DESeq, edgeR, etc... Either or both of these files may be provided. They may be formatted either as a matrix table or 1 individual file for each sample. We are unable to accept your submission without these files. Please submit your processed data files only using the following FTP instructions: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/info/seq.html#data If you have questions, or if we can be of any assistance, please do not hesitate to contact us.  raw data  processed data  公司提供的所有数据  其中Assemble 文件夹中的Unigene 部分数据 |
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