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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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黑西虾虾

新虫 (初入文坛)

[求助] 急!急!急!第一次做PCR条带,求各师哥师姐给看看 已有4人参与

这是我做的PCR条带
我用的酶是ExTaq
体系(50微升):酶                     0.5
                           引物1、引物2:各4
                          buffer:                5
                          dntp:                    5
                          水                           27.5
                          模板:                  4
我想问 :1.我的PCR条带中marker条带为什么有拖尾?
               2.我的marker条带数很多,这个正常么?我用的marker-dL2000,求指教

急!急!急!第一次做PCR条带,求各师哥师姐给看看
PCR.png
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18761615793

木虫 (正式写手)

小虫

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
呵呵,跑的不错啊,marker虽有稍微拖尾,但是不错,胶的浓度是多少呢 可能有点关系,或者是它本身的问题吧
todayisdifficult,tomorrowismoredifficult,butthedayaftertomorrowisbeautiful
2楼2015-03-25 13:12:08
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王平阳

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+3, 鼓励回帖交流 2015-03-26 22:12:06
黑西虾虾: 金币+4, ★★★很有帮助, 给的建议对我很有帮助,可是建议有些给的太多了,只需要回答跟我问题有关的就行了 2015-03-29 15:11:25
首先,跑的带不错,给几个建议:
1、引物加的太多,50  μ L 体系中10 μM 引物上下游分别加2  μL就好了;
2、dNTP加的太多,50  μL 体系加1  μL 就好了;
3、模板也加多了,50  μ L 体系中20 ng/ μL加2 μ L足矣。
4、你这个Marker不是DL2000,DL2000是6条带,分别是2000,,1000,750,500,200,100,其中750带最亮。
5、Marker拖尾除了电泳本身的问题(你这个电泳没有问题的),一般只有一个解释,那就是使用时间长了,部分降解所致。
没有做不到,只有想不到!
3楼2015-03-25 13:22:44
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781055707

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-03-28 23:28:15
marker不是-dL2000,换个其他marker试试,确定下目的片段长度就没事了。
采菊东篱下,悠然见南山。
4楼2015-03-25 13:29:05
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黑西虾虾

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 18761615793 at 2015-03-25 13:12:08
呵呵,跑的不错啊,marker虽有稍微拖尾,但是不错,胶的浓度是多少呢 可能有点关系,或者是它本身的问题吧

我的胶浓度是0.6%,0.6克琼脂糖加入100ml1*TAE(其中1*TAE是用之前师兄师姐跑过多次胶回收来的),要是这个胶浓度有影响的话,我的扩增DNA片段不应该也会拖尾很长么?
5楼2015-03-25 15:41:41
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18761615793

木虫 (正式写手)

小虫

【答案】应助回帖

★ ★
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2015-03-26 22:12:28
引用回帖:
5楼: Originally posted by 黑西虾虾 at 2015-03-25 15:41:41
我的胶浓度是0.6%,0.6克琼脂糖加入100ml1*TAE(其中1*TAE是用之前师兄师姐跑过多次胶回收来的),要是这个胶浓度有影响的话,我的扩增DNA片段不应该也会拖尾很长么?...

你可以先换个其他marker试试,也可能是你的胶局部制得不好吧(可能和TAE有关),也是有可能的。你的TAE跑电泳用多次可以,如果制胶的话,最好用新的,不然分子实验本身就看不见摸不着的,一出问题还得分析找原因,估计
todayisdifficult,tomorrowismoredifficult,butthedayaftertomorrowisbeautiful
6楼2015-03-25 15:52:36
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18761615793

木虫 (正式写手)

小虫

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
黑西虾虾: 金币+6, ★★★很有帮助, 给的建议对我很有帮助 2015-03-29 15:09:19
引用回帖:
5楼: Originally posted by 黑西虾虾 at 2015-03-25 15:41:41
我的胶浓度是0.6%,0.6克琼脂糖加入100ml1*TAE(其中1*TAE是用之前师兄师姐跑过多次胶回收来的),要是这个胶浓度有影响的话,我的扩增DNA片段不应该也会拖尾很长么?...

另外,0.6%的胶适合分离的marker范围是800--12000,所以胶浓度也要考虑其中哦
todayisdifficult,tomorrowismoredifficult,butthedayaftertomorrowisbeautiful
7楼2015-03-25 15:55:22
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aini_222925

金虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-03-28 23:28:37
引物加的太多了,不知道你的引物浓度是多少?一般10uM的引物加1ul就可以了。
我是疯子我怕谁
8楼2015-03-26 17:17:15
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蓝色的心情79

新虫 (初入文坛)

marker 应该不是2000的, 2000的跑出来一共有六条带,分别是100,250,500,750,1000,2000. marker有拖尾的现象可能是你胶的问题。再者, 引物太多,可以试试1ul.
9楼2015-04-03 08:21:39
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