| 查看: 5227 | 回复: 8 | |||
[交流]
关于KEGG和GO的问题！
|
|
KEGG Pathway Annotation和The most enriched pathway terms的区别是什么？分别是干什么用的？ 哪位高手知道，麻烦解答一下，在下被迫做了无参转录组，拿到数据之后一片茫然，不知如何分析，从何下手，请高手指点。 |
回复此楼» 猜你喜欢
Wnt-C59：PORCN靶向化学探针，Wnt信号通路阻断机制与科研应用全解析
已经有0人回复
-
Fexaramine：肠道限制性FXR化学探针，结构特征与信号通路研究全解析
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有73人回复
-
NVS-STG2：靶向STING跨膜域的分子胶类激动剂，结构特征与寡聚化机制研究全解析
已经有0人回复
-
DOTA-GPC3肽（CAS 3066439-94-6）：双功能分子探针前体的结构特征与标记应用解析
已经有0人回复
-
科研用 TLR7/8 双激动剂怎么选？现货与质控要点
已经有0人回复
-
SEL120-34A HCl：CDK8/CDK19高选择性激酶抑制剂
已经有0人回复
-
氢氧化钾活化操作
已经有18人回复
-
散金
已经有68人回复
-
生物质超级电容器
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- MgO稳定的氧化锆陶瓷坩埚问题
已经有8人回复
- RNA测序的问题
已经有4人回复
- GO分析和KEGG pathway分析
已经有18人回复
- 关于Hummers方法制备GO的问题
已经有10人回复
- 要做miRNA的功能的话，用什么分析软件好呢？KEGG、GO、pathway?
已经有5人回复
- 高温堕气中还原GO(氧化石墨烯）的问题讨论
已经有7人回复
- HummerS法制备GO离心洗涤至中性面临一个问题
已经有24人回复
- 【交流】氧化石墨烯GO 测zeta电位有问题
已经有10人回复
- hummer法制备GO中加水的问题
已经有7人回复
 本帖仅楼主可见 |
2楼2015-03-24 20:24:14
xingzhou823
木虫 (正式写手)
五道杠
- 应助: 24 (小学生)
- 金币: 2391.6
- 散金: 200
- 红花: 7
- 帖子: 789
- 在线: 170.7小时
- 虫号: 2070126
- 注册: 2012-10-18
- 性别: GG
- 专业: 生物信息学
★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
东渐于海: 金币+5, 谢谢 2015-03-26 15:29:57
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
东渐于海: 金币+5, 谢谢 2015-03-26 15:29:57
|
两者区别很明显。 前者是功能注释，即每个基因可能参与哪些pathway terms 或者 GO terms，没有阀值的。 后者是功能富集，即基因集（多个基因）可能显著的集中在哪些功能上面，例如选择P<0.05.得到的结果都是显著性富集的pathway terms或者GO terms。 有兴趣的话可以看看中文的web-service工具“云生信”。http://www.biocloudservice.com。里面可以做类似的分析。 另外，如果还想做深入的分析，例如做成一篇有结论的结果，讲成一个story，可以到“云生信”【生物信息群】 424014618 交流学习。 |
3楼2015-03-25 08:52:54
★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
东渐于海: 金币+5, 谢谢 2015-03-26 15:30:17
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
东渐于海: 金币+5, 谢谢 2015-03-26 15:30:17
| GO和Pathway是分析的最基本的，接下来可以根据实验情况和需要可以选择做网络分析等等，向楼主推荐GCBI，http://www.gcbi.com.cn/gclib/html/index，操作简单易懂，能面对多种情况完成多种分析。 |
4楼2015-03-25 11:31:49
5楼2015-03-28 21:11:09
mlanqiang
木虫之王 (文学泰斗)
蓝博士
- 应助: 3409 (副教授)
- 金币: 55278.8
- 散金: 5498
- 红花: 62
- 帖子: 73916
- 在线: 730.8小时
- 虫号: 302202
- 注册: 2006-12-02
- 性别: GG
- 专业: 胶体与界面化学
6楼2015-03-28 21:39:27
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
|
本帖内容被屏蔽 |
7楼2015-07-12 19:53:11
8楼2015-07-13 16:36:33
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
|
本帖内容被屏蔽 |
9楼2015-07-20 16:38:42
5