| 查看: 1704 | 回复: 12 | ||||
| 当前主题已经存档。 | ||||
[交流]
【求助】autodock如何分析dock结果
|
||||
|
使用autodock4将配体和受体dock成功后，可以在adt中看到不同构象的配体与受体的结合方式，请问接下来要如何分析配体与受体的结合方式，如何提取出一个配体和受体结合的pdb文件，我使用summarize_results4.py命令没有成功，请教一下这个py脚本使用有什么需要注意的吗？谢谢各位大侠不吝赐教。 [ Last edited by foradun on 2008-6-25 at 13:58 ] |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 NAMD |
» 猜你喜欢
基于基元I统一理论的量子力学本源推导
已经有1人回复
-
推荐一款可以AI辅助写作的Latex编辑器SmartLatexEditor，超级好用，AI润色，全免费
已经有20人回复
-
物理学I论文润色/翻译怎么收费?
已经有73人回复
-
【EI|Scopus 双检索】第六届智能机器人系统国际会议（ISoIRS 2026）
已经有1人回复
-
2026年第四届电动车与车辆工程国际会议（CEVVE 2026）
已经有0人回复
chemozhang
木虫 (正式写手)
- 应助: 3 (幼儿园)
- 金币: 3431.1
- 散金: 462
- 红花: 12
- 帖子: 615
- 在线: 356小时
- 虫号: 282954
- 注册: 2006-10-08
- 性别: GG
- 专业: 药物学
11楼2008-07-02 10:56:56
gwdavid
木虫 (著名写手)
小木虫散兵坑坑长
- 应助: 0 (幼儿园)
- 贵宾: 0.522
- 金币: 4097.7
- 散金: 1548
- 红花: 57
- 帖子: 1768
- 在线: 151.2小时
- 虫号: 514002
- 注册: 2008-02-28
- 性别: GG
- 专业: 生化分析及生物传感
2楼2008-06-24 15:54:12
顶一下 |
3楼2008-06-25 13:58:34
gwdavid
木虫 (著名写手)
小木虫散兵坑坑长
- 应助: 0 (幼儿园)
- 贵宾: 0.522
- 金币: 4097.7
- 散金: 1548
- 红花: 57
- 帖子: 1768
- 在线: 151.2小时
- 虫号: 514002
- 注册: 2008-02-28
- 性别: GG
- 专业: 生化分析及生物传感
4楼2008-06-25 18:56:33
5楼2008-06-26 15:40:50
6楼2008-06-27 15:33:22
7楼2008-06-28 20:29:57
luai071
木虫 (著名写手)
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 3000.5
- 散金: 100
- 红花: 1
- 帖子: 1348
- 在线: 126.8小时
- 虫号: 351005
- 注册: 2007-04-21
- 专业: 合成药物化学
8楼2008-06-29 08:59:01
gwdavid
木虫 (著名写手)
小木虫散兵坑坑长
- 应助: 0 (幼儿园)
- 贵宾: 0.522
- 金币: 4097.7
- 散金: 1548
- 红花: 57
- 帖子: 1768
- 在线: 151.2小时
- 虫号: 514002
- 注册: 2008-02-28
- 性别: GG
- 专业: 生化分析及生物传感
★ ★ ★
lei0736(金币+3,VIP+0):谢谢 十大“耐思”版主评选欢迎参与投票 http://emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=845527&fpage=1
lei0736(金币+3,VIP+0):谢谢 十大“耐思”版主评选欢迎参与投票 http://emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=845527&fpage=1
|
foradun,我做过一段时间的autodock，个人认为autodock的结果还要靠人的主观性判断多一些，就是要靠一些专业的知识。AUTODOCK最直接的结果是用MGLTOOLS来看，装上它之后就有autodock的工具栏，菜单最后一项有analysis的，其中有show conformation, load conformation, results cluster, show interactions等一些很有用的命令，你可以试一下，应该就是这样的直观的看的！ [ Last edited by gwdavid on 2008-6-29 at 10:27 ] |
9楼2008-06-29 10:25:49
10楼2008-06-30 11:24:59
