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foradun

[交流] 【求助】autodock如何分析dock结果

使用autodock4将配体和受体dock成功后,可以在adt中看到不同构象的配体与受体的结合方式,请问接下来要如何分析配体与受体的结合方式,如何提取出一个配体和受体结合的pdb文件,我使用summarize_results4.py命令没有成功,请教一下这个py脚本使用有什么需要注意的吗?谢谢各位大侠不吝赐教。

[ Last edited by foradun on 2008-6-25 at 13:58 ]
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chemozhang

木虫 (正式写手)

Analyze>>>conformations>>>play
在play界面中再进入set play option 面板中有write complex可以做到将小分子和蛋白输出为pdbq,pdbqt格式,在一般的视图软中可以转化为pdb,在ADT在中也可以做到
故地如重游月圆更寂寞
11楼2008-07-02 10:56:56
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gwdavid

木虫 (著名写手)

小木虫散兵坑坑长

貌似这里做分子对接,基于结构药物设计的不多啊!
个人博客:[url]http://blog.sina.com.cn/gaiwei[/url]
4楼2008-06-25 18:56:33
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foradun

不信没人理 顶顶顶
6楼2008-06-27 15:33:22
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foradun

还真没人理哦
7楼2008-06-28 20:29:57
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