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QM/MM结果分析有问题,求帮忙!!
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本人在做QM/MM能量最小化时,出现了问题,出现LINMIN FAILURE,这该怎么处理啊,求解! 这是输入文件: Initial min of our structure QMMM &cntrl imin=1, maxcyc=10000, ncyc=5000, cut=10.0, ntb=1, ntc=1, ntf=1, ntpr=10, ifqnt=1 / &qmmm qmmask=':21,49-50,265', qmtheory=1,qmcharge=0, itrmax=100000, qmshake=1, qmcut=4.0,qm_ewald=1, qm_pme=1, / 输出文件 NSTEP ENERGY RMS GMAX NAME NUMBER 5390 -1.7469E+05 8.0728E-02 1.0488E+01 CA 798 BOND = 13785.0360 ANGLE = 555.6609 DIHED = 2405.8404 VDWAALS = 35957.3568 EEL = -239558.1381 HBOND = 0.0000 1-4 VDW = 875.6569 1-4 EEL = 11671.2132 RESTRAINT = 0.0000 PM3ESCF = -382.2326 .... RESTARTED DUE TO LINMIN FAILURE ... ***** REPEATED LINMIN FAILURE ***** ***** SEE http://amber.scripps.edu/Questions/linmin.html FOR MORE INFO ***** 这里也说一下,进行QM的原子数目有134个,试问一下,这个输入文件有问题吗,还有结果的linmin failure怎么处理呢? 输入文件 |
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