| 查看: 1597 | 回复: 1 | ||
[求助]
QM/MM结果分析有问题，求帮忙！！
|
|
本人在做QM/MM能量最小化时，出现了问题，出现LINMIN FAILURE，这该怎么处理啊，求解！ 这是输入文件： Initial min of our structure QMMM &cntrl imin=1, maxcyc=10000, ncyc=5000, cut=10.0, ntb=1, ntc=1, ntf=1, ntpr=10, ifqnt=1 / &qmmm qmmask=':21,49-50,265', qmtheory=1,qmcharge=0, itrmax=100000, qmshake=1, qmcut=4.0,qm_ewald=1, qm_pme=1, / 输出文件 NSTEP ENERGY RMS GMAX NAME NUMBER 5390 -1.7469E+05 8.0728E-02 1.0488E+01 CA 798 BOND = 13785.0360 ANGLE = 555.6609 DIHED = 2405.8404 VDWAALS = 35957.3568 EEL = -239558.1381 HBOND = 0.0000 1-4 VDW = 875.6569 1-4 EEL = 11671.2132 RESTRAINT = 0.0000 PM3ESCF = -382.2326 .... RESTARTED DUE TO LINMIN FAILURE ... ***** REPEATED LINMIN FAILURE ***** ***** SEE http://amber.scripps.edu/Questions/linmin.html FOR MORE INFO ***** 这里也说一下，进行QM的原子数目有134个，试问一下，这个输入文件有问题吗，还有结果的linmin failure怎么处理呢？  输入文件 |
回复此楼» 猜你喜欢
求助中医院临床中医中标的青年标书学习，谢谢
已经有6人回复
-
浙大物院表面物理课题组长期招收普博及直博学生
已经有259人回复
-
物理学I论文润色/翻译怎么收费?
已经有221人回复
-
【征稿】Springer Nature热电专题 Discover Materials / Discover Chemistry
已经有47人回复
-
25届硕士申请，材料计算方向
已经有2人回复
-
课题组招1-2名硕士
已经有1人回复
-
机时越来越贵之后，我把一部分 DFT 流程搬到了 AI 计算平台上
已经有0人回复
-
斯坦福大学与Elsevier世界前2%学者新排名查询
已经有1人回复
-
27申博推荐：南京航空航天大学国际前沿院光学方向招收博士生！
已经有19人回复
-
华南师范大学+双一流学科物理学+广东省杰青团队2027年博士招生+机器学习驱动材料设计
已经有1人回复
-
apl投稿状态
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 用高斯QM/MM算频率和QST3
已经有8人回复
- QM/MM和QMCF方法原理
已经有9人回复
- QM/MM计算中如何添加Pb的amber力场参数？
已经有8人回复
- 使用Amber进行QM/MM动力学模拟
已经有5人回复
- 量化文献报告求助
已经有3人回复
- 关于熵变的计算，有人知道怎么计算大的体系的熵变吗？比如将近一千个残基的体系？
已经有11人回复
- AMBER中qm/mm的问题
已经有5人回复
- [求助]QM/MM联用
已经有11人回复
- 第一性原理、分子模拟和量子化学计算之间的区别是什么
已经有23人回复
- 【求助】关于Gaussian计算中的能量问题
已经有14人回复
- 【求助】结构优化-急需解决的问题
已经有7人回复
2楼2018-07-03 17:32:30