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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » lammps的模拟过程中如何添加/删除一定数目的分子？
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wj925806

铜虫 (小有名气)

[求助] lammps的模拟过程中如何添加/删除一定数目的分子？ 已有2人参与

大家好。我用lammps做分子模拟，在模拟过程中每计算2000步，统计某个区域的某种分子(angle 类型的分子)数目，然后根据该数目的多少，添加或删除一定数目的该种分子，不知道能否用lammps的命令直接实现？相当于体系的原子数目随模拟过程中的某个变量而变化。    不知道大家是否有这方面的经验，多多感谢了！
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1楼 2015-01-07 16:37:46
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huachao90

禁虫 (正式写手)
★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
wj925806(月只蓝代发): 金币+3, 感谢应助！ 2015-01-09 10:15:14
本帖内容被屏蔽
2楼2015-01-09 00:24:48
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wang_f_lu

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

先定义一个region **,然后delete_atoms region **删除掉region里的原子 。或者使用delete_atoms group进行操作，详细可以看看lammps相关的manual!
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3楼2015-01-26 09:01:06
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nansh13

金虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by wang_f_lu at 2015-01-26 09:01:06
先定义一个region **,然后delete_atoms region **删除掉region里的原子 。或者使用delete_atoms group进行操作，详细可以看看lammps相关的manual!

你好。请问delete region以后，周期性边界该怎么修改？删除之前是p p p边界。另外，删除后运行时原子会丢失。如何避免，谢谢你。
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苦心人天不负卧薪尝胆三千越甲可吞吴
4楼2017-03-16 19:28:01
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Pipimerry

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by nansh13 at 2017-03-16 19:28:01
你好。请问delete region以后，周期性边界该怎么修改？删除之前是p p p边界。另外，删除后运行时原子会丢失。如何避免，谢谢你。...

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5楼2021-05-10 10:24:37
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