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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 大肠杆菌密码子的偏好性
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liliman2005

新虫 (初入文坛)

[求助] 大肠杆菌密码子的偏好性 已有1人参与

我的实验是合成一段基因，想要在BL21及毕赤酵母中高效表达，如何优化基因序列？知道公司给优化，但是老板让自己优化下，查到可以网上优化或者软件优化，由于初学，不懂怎么优化，有没有哪位大神可以帮忙给下优化的方法或好用的网站。。非常感谢！！看到网上的大肠杆菌密码子偏好性，可以自己找到序列并把利用频率低的直接改为利用频率高的密码子吗？？？  像这样的大肠杆菌密码子偏好性，靠谱吗？还有大家看看这个网站靠谱吗？？把自己的序列复制过来，点create codon usage report 就可以看到结果，这个据说可以直接看到大肠杆菌的密码子偏好性。。。http://www.faculty.ucr.edu/~mmaduro/codonusage/usage.htm

大肠杆菌密码子的偏好性
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1楼 2015-01-06 22:24:20
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jjwhl

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
http://www.genscript.com/cgi-bin/tools/rare_codon_analysis南京金斯瑞公司的网站 具有毕赤酵母与大肠杆菌稀有密码子分析
http://www.kazusa.or.jp/日本Kazusa研究所提供的毕赤酵母稀有密码子分析表 是论文中常出现用来分析稀有密码子的网站
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2楼2015-01-07 19:56:53
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