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qinfenyihao

木虫 (正式写手)

[求助] 怎么用MOE做分子对接 已有1人参与

在做分子对接时,下的蛋白复合物要做什么处理,另外自己的化合物什么时候插进去,要做什么调整吗
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pymol

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【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
删除水分子,多余的配体,然后可以对接了
2楼2015-01-05 09:58:02
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qinfenyihao

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by pymol at 2015-01-05 09:58:02
删除水分子,多余的配体,然后可以对接了

水分子一定要删除吗?配体删除后,我自己的化合物怎么加进去
3楼2015-01-05 12:15:44
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pymol

捐助贵宾 (正式写手)


引用回帖:
3楼: Originally posted by qinfenyihao at 2015-01-05 12:15:44
水分子一定要删除吗?配体删除后,我自己的化合物怎么加进去...

一般是水分子要删除的!晶体结构原有的配体删除后,通过MOE 或者AUTODOCK将自己的化合物对接就可以
4楼2015-01-05 14:00:27
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1225823858zj

金虫 (正式写手)

想飞的风筝

引用回帖:
4楼: Originally posted by pymol at 2015-01-05 14:00:27
一般是水分子要删除的!晶体结构原有的配体删除后,通过MOE 或者AUTODOCK将自己的化合物对接就可以...

想问下,是否方便分享一下分子对接的教程,最近在研究,但是不太懂,也没有合适的教程
The best preparation for tomorrow is doing your best today.
5楼2019-03-23 15:30:26
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