| 查看: 1662 | 回复: 4 | |||
[求助]
共晶分子模拟
|
|
近期在对一共晶分子模拟文献进行重现时遇到了许多问题，麻烦各位解答。谢谢！ 原文章为CL-20分子和TATB分子1：1合成共晶，然后对其进行分子动力学模拟。依照文献，首先建立A分子晶胞和2X2X1超晶胞，然后对超晶胞晶面切割，得到含有8个CL-20分子的晶面，建立真空层。然后用8个TATB分子替换真空层中8个CL-20分子。 问题： 1. 对超晶胞进行晶面切割并建立真空层后，其他分子去哪了？ 2. TATB分子替换CL-20分子后的真空层即为我需要的共晶模型（见图1）吗？ 3. 文献中说要建立CL-20分子中氧元素的径向分布函数，但是CL-20分子都已经被TATB分子替换了，无法对CL-20的氧元素进行edit set，文献中的图是怎么画出来的（见图2）？ 4. 共晶结合能。我对TATB分子替换CL-20分子后的真空层进行优化，得到的体系能量为682kcal/mol，单独的CL-20分子晶胞为-474kcal/mol，单独TATB分子为-543kcal/mol ，这样依据公式“结合能=E（共晶）-E（A）-E（B）得到的为一个正值。但是我看其他文献用上述公式应该为负值，这是怎么回事？是不是共晶体系做错了？  图1.png  图2.png |
回复此楼» 猜你喜欢
垃圾破二本职称评审标准
已经有19人回复
-
职称评审没过，求安慰
已经有53人回复
-
毕业后当辅导员了，天天各种学生超烦
已经有5人回复
-
26申博自荐
已经有3人回复
-
A期刊撤稿
已经有4人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- autodock vina conf.txt 编写求助
已经有5人回复
- 请问这是共晶吗
已经有6人回复
- 共晶化合物会出现在晶内吗
已经有4人回复
- CCDC索取的MOF的cif文件导入到MS中后显示的结构与文献中的不一致
已经有22人回复
- 冻干小试研究顺序，及 共熔点 共晶点的测定
已经有12人回复
- 材料科学基础 中的基础问题
已经有12人回复
- 铁基合金组织来说，亚共晶组织和过共晶组织哪个硬度更高？？？
已经有13人回复
- 药物共晶与混晶怎么区别？
已经有5人回复
- 研究药物晶型，除了研究共晶和多晶型这两个方向，还可以研究哪些方向？
已经有45人回复
- Autodock时 gridbox的参数怎么设置??
已经有18人回复
- sybyl中的配体提取和准备问题
已经有7人回复
- XRPD确定为两种晶型的混晶，如何确定两种晶型的含量？有哪些方法？
已经有6人回复
- 求深共晶的详细概念说明
已经有5人回复
- 共晶成分的合金
已经有5人回复
- 【求助】伪共晶形成的原因是什么
已经有6人回复
- 【讨论】共晶反应是放热还是吸热呢？
已经有6人回复
- 【求助】什么是形核驱动力（在线等）
已经有14人回复
- 【求助】什么是横晶?
已经有6人回复
2楼2014-12-27 15:43:07
3楼2014-12-27 17:47:23
4楼2014-12-28 10:37:54
leonjay1989
新虫 (初入文坛)
| 哎。。。。。 |
5楼2014-12-29 11:14:33