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糊涂仙8889

木虫 (小有名气)

[求助] 求助2基因互作基因定位 已有2人参与

最近研究发现有一个性状是由2个显性基因控制的,而且这2个基因表现为互作关系。
求助:我选用什么样的方法进行基因定位而达到克隆基因的目的?(该作物基因组测序已经完成)
非常感谢!

[ Last edited by 糊涂仙8889 on 2014-12-28 at 14:50 ]
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生活的本质不是索取,而是奋斗!
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2013101102

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
糊涂仙8889: 金币+20, 有帮助 2014-12-31 10:16:14
我觉得你可以把突变体和野生型先杂交,确定两个基因是不是共分离的。或者紧密连锁。然后用相对性状的另一亲本杂交,当然这两个杂交亲本在遗传学上要有差异,从F2挑选对应表型的个体进行连锁和精细定位。我们水稻是这么做的,不知对你是否有帮助。
,越努力越幸运。
2楼2014-12-29 21:32:32
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titus0805

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
糊涂仙8889: 金币+20, 有帮助 2014-12-31 10:18:37
你得先说明你的结论是怎么得出来的,两个显性基因控制,互作关系,这种表达不是很明确。如果是用数量性状遗传遗传体系分析出来的,那我可以理解为,这个性状为数量性状,由两个主效基因控制,两个主效基因均有显性效应,同时两个基因之间还有上位性效应。这样的话,那后面的路还很长,你得先做qtl定位,明确两个基因所在的连锁群(染色体),然后在杂交后代或者回交后代中寻找两个基因分离的群体,分别以定位质量性状的方法对这两个基因作图。细节复杂,路途遥远,可能要做好多年才能真正在基因组中找到基因(除非你做的是模式植物而且运气很好),希望能帮到你,祝你好运。
3楼2014-12-30 11:36:45
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糊涂仙8889

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 2013101102 at 2014-12-29 21:32:32
我觉得你可以把突变体和野生型先杂交,确定两个基因是不是共分离的。或者紧密连锁。然后用相对性状的另一亲本杂交,当然这两个杂交亲本在遗传学上要有差异,从F2挑选对应表型的个体进行连锁和精细定位。我们水稻是这 ...

首先非常感谢!
我还是不太明白,因为我这2个亲本背景差异还是比较大,只是1个抗病,1个感病。我现在是用6世代群体做的遗传规律,其F2完全符合9:7的分离比例,BC1也接近1:3的分离比例。
所以我想请教的是:在这种情况下,怎样确定是否共分离?我目前只有上述2个亲本,相对性状的另1亲本怎么理解?F2挑选对应表型能否详细介绍?
特别感谢!元旦快乐
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4楼2014-12-31 10:15:48
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糊涂仙8889

木虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by titus0805 at 2014-12-30 11:36:45
你得先说明你的结论是怎么得出来的,两个显性基因控制,互作关系,这种表达不是很明确。如果是用数量性状遗传遗传体系分析出来的,那我可以理解为,这个性状为数量性状,由两个主效基因控制,两个主效基因均有显性效 ...

非常感谢!
是这样的,我用6世代群体做的遗传规律,1个亲本是抗病,1个亲本是感病。F1表现为抗病,F2完全符合9:7的分离比例,BC1也接近1:3的分离比例。在种种情况下怎么解决?
特别感谢!元旦快乐
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5楼2014-12-31 10:21:52
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titus0805

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
糊涂仙8889: 金币+10, ★★★很有帮助, 是否有这方面的文献可参考 2015-01-01 09:37:30
引用回帖:
5楼: Originally posted by 糊涂仙8889 at 2014-12-31 10:21:52
非常感谢!
是这样的,我用6世代群体做的遗传规律,1个亲本是抗病,1个亲本是感病。F1表现为抗病,F2完全符合9:7的分离比例,BC1也接近1:3的分离比例。在种种情况下怎么解决?
特别感谢!元旦快乐...

正规做法是做QTL定位。
你这个情况可以试试BSA法,先在亲本间筛多态性标记(最好是已知连锁图谱上的共显性标记,这样就不需要重新作图了),建抗感池,筛出来的标记跑一边。显性抗病有两个,所以比较乱,但感池里面能得到一些结果,就是和抗/感病基因连锁的标记,应该集中在连锁群的两个位置,然后在感病群体里简单作图算个交换律,得出遗传距离,这样大概粗定位就算完成了。
6楼2014-12-31 15:33:30
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