24小时热门版块排行榜    

查看: 2169  |  回复: 14
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

秋之愚

新虫 (正式写手)

[求助] gauss软件优化时两个分子间的相对取相怎么固定 已有2人参与

本人是gauss新手,最近在用gauss优化多分子体系的时候文献上说要固定两个分子的相对方向(relative orientation of the two molecules fixed),想问问各位大神们,比如两个H2O分子,他们的相对方向指的是什么啊,相对方向应该指的不是相对距离吧,还有这在gauss软件的输入文件里该怎么改。。。。。小弟在这先谢谢各位大神了。。。。。。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

快乐学习,学习快乐
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

秋之愚

新虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by fubest at 2014-12-12 22:06:57
把你要固定对应的原子前,改为-1

这不是把分子的坐标固定了吗?各个分子本身的键长键角也还是要优化的。。。文章原文是这么写的
We first obtain the optimized geometry of
NMA– D2O(A) complex, where the site A is occupied by a
single water molecule. Then, the distance r between the
hydrogen-bonding D atom of the D2O(A) and the oxygen
atom of the NMA is increased, with the relative orientations
of the two molecules fixed。。
快乐学习,学习快乐
3楼2014-12-13 12:48:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 15 个回答

fubest

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
把你要固定对应的原子前,改为-1
2楼2014-12-12 22:06:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhou2009

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
秋之愚: 金币+20, 有帮助, 谢谢啊 。。。 2014-12-13 17:35:24
优化时两个分子间的相对取向,比如两个H2O分子,是指二者形成氢键的基本取向,即H2O-1的孤对电子指向H2O-2的HO。这涉及形成氢键的基本格局,键长、键角等,大致符合即可,反正在这个基础上还要优化的。
4楼2014-12-13 15:28:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

秋之愚

新虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by zhou2009 at 2014-12-13 15:28:19
优化时两个分子间的相对取向,比如两个H2O分子,是指二者形成氢键的基本取向,即H2O-1的孤对电子指向H2O-2的HO。这涉及形成氢键的基本格局,键长、键角等,大致符合即可,反正在这个基础上还要优化的。

恩 非常感谢,可我还想问一下,在gauss计算的时候怎么保证这个氢键的取向不变呢。。。
快乐学习,学习快乐
5楼2014-12-13 15:54:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿河工大 081700 276求调剂 +4 地球绕着太阳转 2026-03-23 4/200 2026-03-26 14:27 by zzll406
[考研] 调剂310 +3 温柔的晚安 2026-03-25 4/200 2026-03-25 23:16 by peike
[考研] 285求调剂 +3 AZMK 2026-03-24 3/150 2026-03-25 12:23 by userper
[考研] 求调剂 一志愿 本科 北科大 化学 343 +4 13831862839 2026-03-24 5/250 2026-03-25 09:47 by 无际的草原
[考研] 318求调剂 +5 plum李子 2026-03-21 8/400 2026-03-25 09:26 by aa331100
[考研] 调剂 +4 13853210211 2026-03-24 4/200 2026-03-24 19:44 by ms629
[考研] 070300化学求调剂 +9 苑豆豆 2026-03-20 9/450 2026-03-24 17:15 by licg0208
[考研] 321求调剂 +4 Ymlll 2026-03-24 4/200 2026-03-24 14:44 by sprinining
[考研] 277分求调剂,跨调材料 +3 考研调剂lxh 2026-03-24 3/150 2026-03-24 13:52 by JourneyLucky
[考研] 一志愿华东理工大学081700,初试分数271 +5 kotoko_ik 2026-03-23 6/300 2026-03-24 10:29 by 学术搬砖er
[考研] 一志愿北京化工大学 070300 学硕 336分 求调剂 +7 vv迷 2026-03-22 7/350 2026-03-23 23:44 by Txy@872106
[考研] 384求调剂 +3 子系博 2026-03-22 6/300 2026-03-23 21:45 by 子系博
[考研] 350求调剂 +6 weudhdk 2026-03-19 6/300 2026-03-23 15:47 by tangyuan0840221
[考研] 070300,一志愿北航320求调剂 +3 Jerry0216 2026-03-22 5/250 2026-03-23 09:16 by 。。堂堂
[考研] 315分,诚求调剂,材料与化工085600 +3 13756423260 2026-03-22 3/150 2026-03-22 20:11 by edmund7
[考研] 308求调剂 +3 墨墨漠 2026-03-21 3/150 2026-03-22 16:54 by i_cooler
[考研] 求调剂 +7 Auroracx 2026-03-22 7/350 2026-03-22 12:38 by 素颜倾城1988
[考研] 336求调剂 +5 rmc8866 2026-03-21 5/250 2026-03-21 17:24 by 学员8dgXkO
[考研] 一志愿重庆大学085700资源与环境总分308求调剂 +7 墨墨漠 2026-03-20 7/350 2026-03-21 16:36 by barlinike
[考研] 一志愿西安交通大学 学硕 354求调剂211或者双一流 +3 我想要读研究生 2026-03-20 3/150 2026-03-20 20:13 by JourneyLucky
信息提示
请填处理意见