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lammps新手用tip4p模型模拟水
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现在想用tip4p模型模拟液态水，计算时总是出现错误ERROR on proc:TIP4P hydrogen has incorrect atom type 一开始用pair_style lj/cut/tip4p/long 1 2 1 1 0.15 8.5 8.5就会出错，试着换了个势函数 pair_style lj/cut 8.5 就没出错了，所以我觉得可能是势函数的问题。不过我比较想用tip4p。有没有什么办法呢？本人是非常新的新手，希望能讲的详细一点点。 下面是我的in文件： units metal atom_style full dimension 3 boundary p p p newton on read_data ye.data pair_style lj/cut/tip4p/long 1 2 1 1 0.15 8.5 8.5 pair_coeff 1 1 0.1521 3.154000 8.5 pair_coeff * 2 0.000000 0.000000 8.5 bond_style harmonic bond_coeff 1 450 0.9572 angle_style harmonic angle_coeff 1 55 104.52 kspace_style pppm/tip4p 0.0001 neigh_modify delay 0 every 1 neighbor 2.0 bin timestep 0.0002 velocity all create 400 72489 mom yes rot yes fix 5 all box/relax iso 10 vmax 0.001 min_style cg minimize 1.0e-12 1.0e-12 10000 10000 unfix 5 reset_timestep 0 fix 2 all npt temp 300 300 0.02 iso 10 10 0.2 pchain 8 drag 0.5 thermo 500 #(每200步输出热力学结果) thermo_style custom step temp pe etotal press vol density enthalpy xlo xhi ylo yhi zlo zhi dump 1 all cfg 1000 dump2.temp_*.cfg mass type xs ys zs x y z run 10000 |
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2楼2014-12-11 15:03:13
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chinaboy798
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abinitio: 金币+5, 感谢分享经验 2015-07-23 16:57:47
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帖子是很久以前的了，不知道楼主后来怎么办。分享一点我的经验。 根据mannual里面的语句介绍 pair_style lj/cut/tip4p/long 1 2 1 1 0.15 8.5 8.5 中第一个“1”表示O原子atom type =1, 后面的“2”表示H原子atom type=2，这个要与输入的data文件对应，可能楼主的data文件里是反的，H的atom type=1了。 在 pair_style lj/cut 8.5语句中，没有关于这类参数的定义，只设定截断距离，因此不存在与data文件对应问题，所以不报错吧。 希望能给以后遇到同样问题的木虫一点小小的帮助~ |
6楼2015-07-19 09:35:50
chibang367
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7楼2016-03-06 22:33:39
chibang367
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8楼2016-03-06 23:38:00