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fengjingyi

铁虫 (初入文坛)

[求助] lammps新手用tip4p模型模拟水

现在想用tip4p模型模拟液态水,计算时总是出现错误ERROR on proc:TIP4P hydrogen has incorrect atom type
一开始用pair_style lj/cut/tip4p/long 1 2 1 1 0.15 8.5 8.5就会出错,试着换了个势函数
pair_style lj/cut 8.5
就没出错了,所以我觉得可能是势函数的问题。不过我比较想用tip4p。有没有什么办法呢?本人是非常新的新手,希望能讲的详细一点点。
下面是我的in文件:
units metal
atom_style  full
dimension 3
boundary p p p        
newton on

read_data    ye.data
pair_style lj/cut/tip4p/long 1 2 1 1 0.15 8.5 8.5
pair_coeff 1 1 0.1521 3.154000 8.5
pair_coeff * 2 0.000000 0.000000 8.5

bond_style     harmonic
bond_coeff     1  450  0.9572
angle_style    harmonic
angle_coeff    1  55  104.52

kspace_style   pppm/tip4p 0.0001   

neigh_modify delay 0 every 1
neighbor 2.0 bin
         
timestep  0.0002

velocity  all  create  400  72489 mom yes rot yes     
fix 5 all box/relax iso 10 vmax 0.001        
min_style cg
minimize 1.0e-12 1.0e-12 10000 10000
unfix 5

reset_timestep 0   

fix 2 all  npt  temp 300 300 0.02 iso 10 10 0.2 pchain 8 drag 0.5

thermo   500     #(每200步输出热力学结果)
thermo_style custom step temp pe etotal press vol density enthalpy xlo xhi ylo yhi zlo zhi

dump      1 all cfg 1000 dump2.temp_*.cfg mass type xs ys zs x y z

run             10000
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chibang367

银虫 (小有名气)

楼主,请问bond_coeff     1  450  0.9572中的450怎么获得的
7楼2016-03-06 22:33:39
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查看全部 8 个回答

fengjingyi

铁虫 (初入文坛)

各位大神帮帮忙呀
2楼2014-12-11 15:03:13
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gulubaozi

银虫 (小有名气)

楼主,
reset_timestep 0
这个命令是用来做什么的?为什么设为 0 呢?
3楼2015-01-12 15:37:17
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chinaboy798

银虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by gulubaozi at 2015-01-12 15:37:17
楼主,
reset_timestep 0
这个命令是用来做什么的?为什么设为 0 呢?

把步长计数器清零
4楼2015-02-07 14:30:01
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