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eskimo_0_0

铁虫 (初入文坛)

[求助] 问下大家这个跑胶图最下面的条带是二聚体吗?怎么除不掉 已有1人参与

这两幅图分别是昨天和今天做的细菌菌落的目的基因pcr,共有5个基因,片段长均在100-200bp。引物在设计的时候基本都是选择的没有二聚体的。
第一幅图是昨天做的结果,1μl 浓度为10μM的引物,分别用了60-58-52依次降低的退火温度,退火时间55s。上样量5μl。发现下面有亮的宽带,今天就重复做了一次。
今天引物用了10μM的引物0.2、0.5、1μl三个浓度,60-55-50依次降低的退火温度,退火时间30s。上样量2.5μl,还是有最下面的亮的宽带。
另外今天多挑了一些菌,增大了模板量,昨天的结果感觉已经有拖尾了应该就是模板量太大的原因吧。菌是直接挑的没有煮沸。

想问下大家最下面宽的亮的带是二聚体么,这个可以避免么,还是所有pcr产物的跑胶结果都会有这个带。
因为这个是想给q-pcr设计的引物,所以不知道这个东西有没有影响。

问下大家这个跑胶图最下面的条带是二聚体吗?怎么除不掉
2014-11-26.jpg


问下大家这个跑胶图最下面的条带是二聚体吗?怎么除不掉-1
2014-11-27.png
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jurkat.1640

至尊木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

★
感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香,分子生物期待你更多精彩。 2014-11-28 12:54:12
引物大概25 bp大小,你的引物加多了,只要过剩就有。
2楼2014-11-28 09:17:14
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eskimo_0_0

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by jurkat.1640 at 2014-11-28 09:17:14
引物大概25 bp大小,你的引物加多了,只要过剩就有。

可是我稀释了引物还是有呀

下面的图三个为一组 引物浓度依次稀释过了的
3楼2014-11-28 11:06:16
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