24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 3876  |  回复: 5
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

xinyou519

新虫 (初入文坛)

[求助] 关于miRNA前体序列的问题 已有2人参与

我利用生物信息学方法预测了几个新的保守miRNA,要对其前体序列进行预测,预测的时候用miRNA比对的时候去比对什么序列呢,是该物种的EST,GSS,nt,还是蛋白质库呢?比对上了,上下游序列怎么取?取多长?然后再进行二级结构预测. 希望各位兄弟姐妹知道一下,谢谢
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xinyou519

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 小松果2012 at 2014-11-20 13:27:50
首先你预测miRNA的目的是什么?预测到保守的之后不应该验证吗?

就是计算机预测保守miRNA,预测出来以后不是要匹配它的前体序列,才能称之为可能的miRNA,最后才是验证。
3楼2014-11-21 11:41:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

小松果2012

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
首先你预测miRNA的目的是什么?预测到保守的之后不应该验证吗?
2楼2014-11-20 13:27:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小松果2012

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by xinyou519 at 2014-11-21 11:41:33
就是计算机预测保守miRNA,预测出来以后不是要匹配它的前体序列,才能称之为可能的miRNA,最后才是验证。...

可能我们做的不太一样吧,那你怎么看它是否匹配呢?
4楼2014-11-21 21:27:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

growlywolf

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
直接比genomic sequence
虽然miRNA前体应该是转录出来的,但由于其成熟过程中会自我剪切,EST测序不一定能测到。
上下游一般各取150-200吧,动物的可能可以取得短一点。
5楼2014-11-22 09:57:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料专硕322分 +11 哈哈哈吼吼吼哈 2026-04-02 11/550 2026-04-04 23:37 by 永字号
[考研] 求生物学学硕调剂——364分 +7 云朵遛弯指南 2026-04-04 7/350 2026-04-04 22:49 by zhyzzh
[考研] 288求调剂,一志愿华南理工大学071005 +4 ioodiiij 2026-04-04 4/200 2026-04-04 22:49 by barlinike
[考研] 282求调剂 +6 aaa车辆 2026-04-02 9/450 2026-04-04 22:15 by arrow8852
[考研] 材料科学与工程调剂 +19 深V宿舍吧 2026-03-30 20/1000 2026-04-04 22:13 by hemengdong
[考研] 349求调剂 +11 zwjjjjjj 2026-03-31 11/550 2026-04-04 19:52 by 蓝云思雨
[考研] 295求调剂 +6 xndjjj 2026-04-04 6/300 2026-04-04 16:52 by dongzh2009
[考研] 309求调剂 +4 快乐的小白鸽 2026-04-04 5/250 2026-04-04 15:55 by cql1109
[考研] 一志愿沪985,326分求调剂 +3 刘墨墨 2026-04-03 3/150 2026-04-04 11:16 by 悲伤的芋头
[考研] 兽医调剂 +3 wh119216 2026-04-02 3/150 2026-04-03 19:34 by zrongyan
[考研] 机械专硕297 +3 Afksy 2026-04-03 3/150 2026-04-03 14:24 by 1753564080
[考研] 0703化学 +7 goldtt 2026-04-02 9/450 2026-04-03 09:36 by 蓝云思雨
[考研] 一志愿深大085601材料工程专业(专硕)300分可以调剂去哪 +8 10160315 2026-04-02 8/400 2026-04-03 09:36 by hypershenger
[考研] 266求调剂 +4 学员97LZgn 2026-04-02 4/200 2026-04-02 13:03 by yulian1987
[考研] 0710生物学,325求调剂 +3 mkkkkkl 2026-04-01 3/150 2026-04-02 09:48 by Jaylen.
[考研] 化学工程专硕324分,一志愿中国矿业大学求调剂 +7 耿耿1314 2026-04-01 7/350 2026-04-02 07:40 by 尚水阁主
[考研] 304求调剂 +12 素年祭语 2026-03-31 15/750 2026-04-01 22:41 by peike
[考研] 080200学硕,机械工程专业277分,求带走! +4 瓶子PZ 2026-03-31 4/200 2026-03-31 20:16 by vgtyfty
[考研] 材料工程专硕求调剂 +10 hyl3153942 2026-03-29 10/500 2026-03-31 16:31 by hypershenger
[考研] 调剂 +4 GK72 2026-03-30 4/200 2026-03-30 20:32 by dick_runner
信息提示
请填处理意见