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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » DGGE银染，泳道颜色为什么这么深？
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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three姚

兑换贵宾

优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！

[求助] DGGE银染，泳道颜色为什么这么深？ 已有3人参与

如下图，我这批样品的PCR条带不是特别亮，所以DGGE效果也不好，只能隐约看到一些很浅的条带，但是不知道为什么泳道的颜色特别深，尤其是顶部和底部颜色很深，还有之前一次做的条带很清晰，但是泳道颜色也很深，想请教一下是什么原因？我用的引物是f338-GC/r518，胶的浓度是8%，变性梯度40~65%，染色方法是银染法。具体染色过程是：
1.取下胶板后，放在塑料盘里，用去离子水把胶从玻璃板上洗下来，再多清洗一次（每次清洗1~2min）
2. 加250ml固定液（10%冰醋酸溶液）固定15min
3. 倒掉固定液，去离子水洗两次（每次1~2min）
4. 加250ml印染液（0.2%硝酸银溶液，用之前加200μL甲醛），轻轻摇动，染色15min
5. 倒掉印染液，去离子水洗两次（每次1~2min）
6. 加250ml显色液（1.5% NaOH溶液，用之前加1.25ml甲醛），轻轻摇动，直到条带清晰为止（15~20min）
（所有溶液都没有重复利用，都是从事先配好的溶液里取的）

因为实验比较急，希望大家能提供一些合理的建议和可行的方法，多谢了！

DGGE银染，泳道颜色为什么这么深？
这一次的结果


DGGE银染，泳道颜色为什么这么深？-1
之前一次的结果，条带很清晰，但是泳道颜色还是很深
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思念是一棵没有年轮的树，永不老去
1楼 2014-11-13 15:54:17
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Rubisco580

兑换贵宾

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【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香，分子生物期待你更多精彩。 2014-11-14 14:06:58
看你用的是强碱NaOH，要不试试碳酸钠显色？浓度嘛，我染蛋白是2.5%，不知道你这个应该多大浓度，可以试试。
还有，硝酸银溶液那步要避光摇动，不然背景深。
显色久了背景也会很深。
希望对你有帮助。
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2楼2014-11-14 10:57:40
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three姚

专家顾问

优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！
引用回帖:
2楼: Originally posted by Rubisco580 at 2014-11-14 10:57:40
看你用的是强碱NaOH，要不试试碳酸钠显色？浓度嘛，我染蛋白是2.5%，不知道你这个应该多大浓度，可以试试。
还有，硝酸银溶液那步要避光摇动，不然背景深。
显色久了背景也会很深。
希望对你有帮助。

谢谢回复，弱碱法我确实没试过，可以试一下。您说显色久了背景会深，但是我这在条带出现之前泳道就显色了，等条带清晰了泳道就变得这么深了，所以可能主要不是时间的问题。。。不过染色那步我都没有避光，这一点您提醒了我，改天要试一下。多谢了！
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思念是一棵没有年轮的树，永不老去
3楼2014-11-14 12:14:33
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guo29

专家顾问

优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！

【答案】应助回帖

★ ★
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2014-11-19 09:46:12
我用康为世纪的银染试剂盒效果还可以，但银染麻烦，怎么才能洗多次胶不破能，8%太软了胶。我用SYBR Green I染20分钟也挺清楚果断换 SYBR Green I了。
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4楼2014-11-18 19:02:05
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lance-tan

主管区长

优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！

【答案】应助回帖

1.银染要避光。2.建议第一步固定的时候，固定两次，每次固定完后去离子水洗涤10min(目的去掉尿素)。3.显色时间需要把握好。
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新手入门求各位大神指导
5楼2014-11-22 21:04:47
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二月smile

管理员

优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！
楼主解决了吗？
我现在也遇到这种问题了。不懂啊。
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6楼2016-05-01 20:14:37
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