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怎么从cif文件中提取所需要的分子的pdb文件？
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我需要初始的b-cyclodextrin的pdb文件，于是按照参考文献，在CCDC下载了BCD-12H2O.cif 文件。 然后用GaussView打开，另存为pdb，再用VMD将pdb打开，看到一些破碎的b-cyclodextrin片段，还有一些水分子。 所以我的问题是，我该怎么得到b-cyclodextrin完整且单独的（无水）的pdb文件？或者是需要什么软件来做转化？ 这个貌似是做分子模拟的基础问题  ，但是很困扰我啊，希望大家不吝指导！O(∩_∩)O谢谢 |
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2楼2014-10-29 11:26:43