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chtao0924

新虫 (初入文坛)

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[求助] 请教一些共显性的标记问题已有1人参与

共显性是指能同时表达的一对等位基因，微卫星中扩增的不是都是基本与基因表达无关的重复序列吗，而PCR的模板链为双链DNA分子，其上面应该是只有一对等位基因的其中一个基因（比如A或者a），为什么泳道中会有两条带，并且可以判断其为杂合子，一条带的时候为纯合子？

因为初学，看了些pcr的原理，我是不是有什么概念上的东西搞错了？请大家不吝赐教，谢谢！

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1楼2014-10-17 21:09:55

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南有乔木张恺

木虫 (正式写手)

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引用回帖:

6楼: Originally posted by badman20 at 2014-10-18 08:55:10
SSR标记和真正的基因是有本质区别的，简单来说，SSR标记只是可以知道来自父本和母本的同源染色体上的对应位点的DNA序列（重复序列数目）是否相同，这段序列可能是有功能的，也可能是没有功能的。而真正的基因与性状 ...

也就是说，ssr标记，对于二倍体的话只能扩增出来1条带就是纯合，两条带就是杂合，但是我做的ssr为什么能扩增出4,5条带呢，2倍体。ssr是串联重复序列两端保守序列设计引物，但是一个基因组中会有很多个重复序列。因此会跑出很多个不一样的条带，这个和纯合杂合没有关系吧。我这样理解，不对的地方请指导。

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7楼2016-01-22 19:53:28

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badman20

木虫 (小有名气)

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【答案】应助回帖

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LZ需要恶补相关知识

。首先，扩增出来的条带不一定是与基因表达无关的，如果扩增片段在基因的外显子里面（EST序列），就很可能与表达密切相关；第二，PCR模板为双链DNA分没错，但是理想状态下SSR扩增的条代并不是来自同一DNA分子（或者说同一条染色体），而是分别来自两条（二倍体）或多条（多倍体）不同的染色体（同源染色体，半数来自父本，半数来自母本）。如果来自父本的染色体上的DNA序列与来自母本的对应位点的序列相同，则扩增出来体现为一条带（即纯合子），反之如来自父本的DNA对应位点与母本的不同，则体现为两条带（即杂合子）。