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chtao0924

新虫 (初入文坛)

[求助] 请教一些共显性的标记问题 已有1人参与

共显性是指能同时表达的一对等位基因,微卫星中扩增的不是都是基本与基因表达无关的重复序列吗,而PCR的模板链为双链DNA分子,其上面应该是只有一对等位基因的其中一个基因(比如A或者a),为什么泳道中会有两条带,并且可以判断其为杂合子,一条带的时候为纯合子?

因为初学,看了些pcr的原理,我是不是有什么概念上的东西搞错了?请大家不吝赐教,谢谢!
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chtao0924

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by badman20 at 2014-10-17 22:29:45
LZ需要恶补相关知识。首先,扩增出来的条带不一定是与基因表达无关的,如果扩增片段在基因的外显子里面(EST序列),就很可能与表达密切相关;第二,PCR模板为双链DNA分没错,但是理想状态下SSR扩增的条代并不是来 ...

谢谢,那么这两条带分别代表的是不同的等位基因是吗,比如说A和B?
共显性标记只能看出杂合和纯合,而看不出显隐性是吗,比如A和a?
3楼2014-10-17 22:53:08
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badman20

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
LZ需要恶补相关知识。首先,扩增出来的条带不一定是与基因表达无关的,如果扩增片段在基因的外显子里面(EST序列),就很可能与表达密切相关;第二,PCR模板为双链DNA分没错,但是理想状态下SSR扩增的条代并不是来自同一DNA分子(或者说同一条染色体),而是分别来自两条(二倍体)或多条(多倍体)不同的染色体(同源染色体,半数来自父本,半数来自母本)。如果来自父本的染色体上的DNA序列与来自母本的对应位点的序列相同,则扩增出来体现为一条带(即纯合子),反之如来自父本的DNA对应位点与母本的不同,则体现为两条带(即杂合子)。
2楼2014-10-17 22:29:45
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chtao0924

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by badman20 at 2014-10-17 22:29:45
LZ需要恶补相关知识。首先,扩增出来的条带不一定是与基因表达无关的,如果扩增片段在基因的外显子里面(EST序列),就很可能与表达密切相关;第二,PCR模板为双链DNA分没错,但是理想状态下SSR扩增的条代并不是来 ...

还有,微卫星扩增的简单串联重复序列,是因为存在不同的等位基因才导致重复序列片段大小不同而呈现不同的条带的吗?
一个位点可能会有多个等位基因,为什么一般只有两个等位基因条带,会不会有3个或更多等位基因而出多个杂合条带的情况?
4楼2014-10-17 23:03:11
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badman20

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
chtao0924: 金币+5, ★★★很有帮助, 非常感谢,了解了 2014-10-18 10:54:05
引用回帖:
4楼: Originally posted by chtao0924 at 2014-10-17 23:03:11
还有,微卫星扩增的简单串联重复序列,是因为存在不同的等位基因才导致重复序列片段大小不同而呈现不同的条带的吗?
一个位点可能会有多个等位基因,为什么一般只有两个等位基因条带,会不会有3个或更多等位基因而 ...

首先,SSR只是一个区分个体的标记,不一定直接与基因相关,如果SSR位于非编码区,则SSR重复次数的变化可能不影响基因的功能表达,但是如果SSR位于基因编码区,那么显然SSR重复次数的变异会影响到基因编码蛋白的序列,就与基因表达直接相关。第二,如果你研究的材料(生物体)是二倍体(比如人),那么扩增出来的条带只有1条(纯合子)或2条带(杂合子),但如果材料为多倍体,比如很多植物(如小麦(六倍体)、马铃薯(四倍体)等)扩增出来的条带可能就会有多个条带。
5楼2014-10-18 08:44:08
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