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ifgovh

金虫 (小有名气)

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[求助] vasp运行报错已有3人参与

各位大侠我安装各种教程装了VASP，把四个输入文件放在一个文件夹内，再把vasp复制到这个文件夹中。
执行如下：
[wangch@fat01 vasp.5.2]$ mpirun -np 16 vasp
problem with execution of vasp  on  fat01:  [Errno 2] No such file or directory
problem with execution of vasp  on  fat01:  [Errno 2] No such file or directory
problem with execution of vasp  on  fat01:  [Errno 2] No such file or directory
problem with execution of vasp  on  fat01:  [Errno 2] No such file or directory
problem with execution of vasp  on  fat01:  [Errno 2] No such file or directory
problem with execution of vasp  on  fat01:  [Errno 2] No such file or directory
problem with execution of vasp  on  fat01:  [Errno 2] No such file or directory
problem with execution of vasp  on  fat01:  [Errno 2] No such file or directory
problem with execution of vasp  on  fat01:  [Errno 2] No such file or directory
problem with execution of vasp  on  fat01:  [Errno 2] No such file or directory
problem with execution of vasp  on  fat01:  [Errno 2] No such file or directory
problem with execution of vasp  on  fat01:  [Errno 2] No such file or directory
problem with execution of vasp  on  fat01:  [Errno 2] No such file or directory
problem with execution of vasp  on  fat01:  [Errno 2] No such file or directory
problem with execution of vasp  on  fat01:  [Errno 2] No such file or directory
problem with execution of vasp  on  fat01:  [Errno 2] No such file or directory
总是出现这个报错，不知道到底什么原因？

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1楼 2014-09-24 22:51:35

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shuyuan8239

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【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2014-09-29 07:45:27

在论坛中询问类似的问题很多，各不相同。
还请将INCAR KPOINT POSCAR三个文件中的数据复制上来(不要上传文件)，注意条理性，简介详实。
这样的话方便大家帮你解决问题。

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2楼2014-09-25 08:45:48

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引用回帖:

2楼: Originally posted by shuyuan8239 at 2014-09-25 08:45:48
在论坛中询问类似的问题很多，各不相同。
还请将INCAR KPOINT POSCAR三个文件中的数据复制上来(不要上传文件)，注意条理性，简介详实。
这样的话方便大家帮你解决问题。

incar
system= Clean relaxation calculation
#Startparameter for this run
ISTART=0
ICHARG=2
ISPIN=2
PREC=Medium
ENCUT= 450
GGA= PE
ALGO=FAST

#Electronic relaxation
NELM=400; NELMIN=10;
NELMDL=8
WEIMIN=0
LREAL=AUTO
EDIFF=0.1E-3
ISMEAR=0; SIGMA=0.02

LMAXMIX=4

AMIX    = 0.2
BMIX    = 0.00001
AMIX_MAG = 0.8
BMIX_MAG = 0.00001

#Ionic relaxation
EDIFFG=-0.02
NSW=500
IBRION=2
ISIF=3
ISYM=0
POTIM=0.3

#Write flag
LWAVE=.F.
LCHARG=.F.

kpoint
con0.0
0
Gamma point shift
4 4 4
0 0 0

poscar
Si
1.0
      5.4306998253       0.0000000000       0.0000000000
      0.0000000000       5.4306998253       0.0000000000
      0.0000000000       0.0000000000       5.4306998253
Si
8
Cartesian
   0.000000000       0.000000000       0.000000000
   0.000000000       2.715349913       2.715349913
   2.715349913       2.715349913       0.000000000
   2.715349913       0.000000000       2.715349913
   4.073024869       1.357674956       4.073024869
   1.357674956       1.357674956       1.357674956
   1.357674956       4.073024869       4.073024869
   4.073024869       4.073024869       1.357674956

实际我只是想测试一下我的vasp是不是真正编译成功可用了用了一个很简单的Si

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3楼2014-09-25 12:02:21

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【答案】应助回帖

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感谢参与，应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2014-09-29 07:45:37

楼主很可能没编译成功....
这种情况，先试试which vasp，或者直接vasp命令一下，看看，先别并行....
一般来说输入文件有问题，不会出现这类错误

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4楼2014-09-25 12:23:53

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【答案】应助回帖

★
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2014-09-29 07:45:43

另外，你需要把vasp复制到bin中，这样直接当命令用，或者在~/.bashrc中添加途径

建议还是复制到bin中试试

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5楼2014-09-25 12:27:05

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4楼: Originally posted by Jiansh at 2014-09-25 12:23:53
楼主很可能没编译成功....
这种情况，先试试which vasp，或者直接vasp命令一下，看看，先别并行....
一般来说输入文件有问题，不会出现这类错误

输入which vasp
[wangch@fat01 vasp.5.2]$ which vasp
/usr/bin/which: no vasp in (/opt/intel/composer_xe_2011_sp1.10.319/bin/intel64:/usr/local/maui/bin:/usr/lib64/qt-3.3/bin:/usr/kerberos/sbin:/usr/kerberos/bin:/usr/local/bin:/bin:/usr/bin:/usr/local/sbin:/usr/sbin:/sbin:/opt/bin:/opt/intel/composer_xe_2011_sp1.10.319/mpirt/bin/intel64:/home/wangch/bin)

这样算正常吗？

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6楼2014-09-25 18:38:39

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5楼: Originally posted by Jiansh at 2014-09-25 12:27:05
另外，你需要把vasp复制到bin中，这样直接当命令用，或者在~/.bashrc中添加途径

建议还是复制到bin中试试

辅助到bin中
[wangch@fat01 vasp.5.2]$ sudo cp vasp /bin
再输入which vasp提示
[wangch@fat01 vasp.5.2]$ sudo cp vasp /bin
然后我又运行了一次提示这个
[wangch@fat01 vasp.5.2]$ cd /data/wangch/test/
[wangch@fat01 test]$ mpirun -np 16 vasp
mpiexec_fat01: cannot connect to local mpd (/tmp/mpd2.console_wangch); possible causes:
1. no mpd is running on this host
2. an mpd is running but was started without a "console" (-n option)
In case 1, you can start an mpd on this host with:
mpd &
and you will be able to run jobs just on this host.
For more details on starting mpds on a set of hosts, see
the MPICH2 Installation Guide.
[wangch@fat01 test]$

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7楼2014-09-25 18:42:51

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之后我按照提示输入mpd &
再运行
[wangch@fat01 test]$ mpd &
[1] 175272
[wangch@fat01 test]$ mpirun -np 16 vasp
vasp: error while loading shared libraries: libmpi_f90.so.0: cannot open shared object file: No such file or directory
vasp: error while loading shared libraries: libmpi_f90.so.0: cannot open shared object file: No such file or directory
vasp: error while loading shared libraries: libmpi_f90.so.0: cannot open shared object file: No such file or directory
vasp: error while loading shared libraries: libmpi_f90.so.0: cannot open shared object file: No such file or directory
vasp: error while loading shared libraries: libmpi_f90.so.0: cannot open shared object file: No such file or directory
vasp: error while loading shared libraries: libmpi_f90.so.0: cannot open shared object file: No such file or directory
vasp: error while loading shared libraries: libmpi_f90.so.0: cannot open shared object file: No such file or directory
vasp: error while loading shared libraries: libmpi_f90.so.0: cannot open shared object file: No such file or directory
vasp: error while loading shared libraries: libmpi_f90.so.0: cannot open shared object file: No such file or directory
vasp: error while loading shared libraries: libmpi_f90.so.0: cannot open shared object file: No such file or directory
vasp: error while loading shared libraries: libmpi_f90.so.0: cannot open shared object file: No such file or directory
vasp: error while loading shared libraries: libmpi_f90.so.0: cannot open shared object file: No such file or directory
vasp: error while loading shared libraries: libmpi_f90.so.0: cannot open shared object file: No such file or directory
vasp: error while loading shared libraries: libmpi_f90.so.0: cannot open shared object file: No such file or directory
vasp: error while loading shared libraries: libmpi_f90.so.0: cannot open shared object file: No such file or directory
vasp: error while loading shared libraries: libmpi_f90.so.0: cannot open shared object file: No such file or directory
说缺少这个库文件非常纳闷当时编译通过还能找不到这个库文件吗？

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8楼2014-09-25 18:49:19

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