24小时热门版块排行榜    

查看: 1564  |  回复: 6

xiemeng101

新虫 (小有名气)

[求助] 氢键与其他弱作用力存在时,能单独求出氢键的大小吗 已有1人参与

欲计算分子间的氢键的大小,从文献得知这两个分子之间存在氢键(占主导作用)和其他的弱相互作用,有什么办法能抛开其他作用力而单独计算氢键的大小吗?
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

经验

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiewei

专家顾问 (著名写手)

小才

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
xiemeng101: 金币+6, ★★★很有帮助 2014-09-20 16:39:24
gmy1990: 金币+2 2014-09-21 06:05:02
假设分子1为 AOH; 分子2 为BF
计算二聚体的能量E(AOH BF),计算分子1的能量
将分子1的OH基的H调整位置使得不和分子2的F产生氢键作用。 这个时候分子1为AOH*。  计算二聚体的能量E(AOH* BF),计算分子1*的能量,
氢键的能量为:  E(AOH BF) -E(AOH* BF)- (E1*-E1)
我想做个科学家,可我又喜欢写诗;我想做一个诗人,可我却读的理工科..
2楼2014-09-20 16:28:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

戴世杰

木虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by jiewei at 2014-09-20 16:28:24
假设分子1为 AOH; 分子2 为BF
计算二聚体的能量E(AOH BF),计算分子1的能量
将分子1的OH基的H调整位置使得不和分子2的F产生氢键作用。 这个时候分子1为AOH*。  计算二聚体的能量E(AOH* BF),计算分子1*的能量,
...

我觉得E1*-E1没有必要考虑,计算E(AOH* BF)的能量时,分子1和分子2的构型和成氢键时相同,只是没有氢键作用,不用优化 直接计算SP,你觉得呢?
3楼2014-09-21 10:59:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiewei

专家顾问 (著名写手)

小才

引用回帖:
3楼: Originally posted by 戴世杰 at 2014-09-21 10:59:31
我觉得E1*-E1没有必要考虑,计算E(AOH* BF)的能量时,分子1和分子2的构型和成氢键时相同,只是没有氢键作用,不用优化 直接计算SP,你觉得呢?...

我觉得你说得不对,人家前提是明确有提示说氢键只是主导,而不是全部作用力。 如果照你的说法最后的结果色散会被你纳入氢键的作用的
我想做个科学家,可我又喜欢写诗;我想做一个诗人,可我却读的理工科..
4楼2014-09-22 10:28:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

十年磨练

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by jiewei at 2014-09-20 16:28:24
假设分子1为 AOH; 分子2 为BF
计算二聚体的能量E(AOH BF),计算分子1的能量
将分子1的OH基的H调整位置使得不和分子2的F产生氢键作用。 这个时候分子1为AOH*。  计算二聚体的能量E(AOH* BF),计算分子1*的能量,
...

专家,你好:

我最近也在纠结这个问题,像你说的这种方法是在gaussian软件下得到的结果吧。但是,对于“将分子1的OH基的H调整位置使得不和分子2的F产生氢键作用”这句话,我如果将两个分子放在一起使它们不形成氢键,但是通过opt之后还是会形成氢键的,难道是将他们放在一定的位置不形成氢键 直接计算他们的总能量吗?

求解答,在此谢谢了
时刻保持虚心学习的态度
5楼2015-06-22 15:49:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiewei

专家顾问 (著名写手)

小才

引用回帖:
5楼: Originally posted by 十年磨练 at 2015-06-22 15:49:57
专家,你好:

我最近也在纠结这个问题,像你说的这种方法是在gaussian软件下得到的结果吧。但是,对于“将分子1的OH基的H调整位置使得不和分子2的F产生氢键作用”这句话,我如果将两个分子放在一起使它们不形成 ...

对高斯。
放远点

[ 发自小木虫客户端 ]
我想做个科学家,可我又喜欢写诗;我想做一个诗人,可我却读的理工科..
6楼2015-06-22 17:57:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

十年磨练

木虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by jiewei at 2015-06-22 17:57:43
对高斯。
放远点
...

哦,那那样的话,他们之间的其他弱相互作用应该也就下差很大了吧。像你说的那样,一般放多远,有没有一个标准什么的?
时刻保持虚心学习的态度
7楼2015-06-23 10:29:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 xiemeng101 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 不应该看fileCode +5 且听虎啸 2026-08-12 5/250 2026-08-12 16:19 by 云上清扬
[基金申请] FileCode能看出啥? +8 要乐观耀哥 2026-08-10 21/1050 2026-08-12 16:08 by 云上清扬
[基金申请] 长年满屏的广告,版主太不责任了。基金也等的急 +4 gltch 2026-08-12 4/200 2026-08-12 16:08 by eulota
[基金申请] filecode +13 documentary 2026-08-10 15/750 2026-08-12 15:56 by 云上清扬
[基金申请] 关于Filecode分析方法 +4 majunge000 2026-08-10 4/200 2026-08-12 15:46 by 云上清扬
[论文投稿] 职称评审,求友友推荐见刊最快的期刊 +4 工厂打螺丝 2026-08-08 4/200 2026-08-12 09:18 by hansi2025
[基金申请] 小木虫上这么多卖论文的,真有人买论文么?感觉没必要啊 +8 Tide man 2026-08-10 9/450 2026-08-11 20:39 by beefly
[基金申请] 帮忙看看fileCode +7 wwncly 2026-08-10 13/650 2026-08-11 19:36 by 冰心玉壶晴
[硕博家园] 读博的好处 +3 lnee 2026-08-11 3/150 2026-08-11 18:10 by 希望我好好的
[基金申请] 什么时候出结果,有咨询渠道??? +3 Tide man 2026-08-11 3/150 2026-08-11 17:54 by kudofaye
[基金申请] 分享一下我之前已中青C的计划书的filecode +3 布布和一二 2026-08-11 4/200 2026-08-11 15:20 by aasahr
[基金申请] 确定了,国自然21号放榜 +6 布布和一二 2026-08-10 7/350 2026-08-10 19:15 by 2000zf36392
[基金申请] 关于代码变化问题,想知道的进来 +17 且听虎啸 2026-08-07 24/1200 2026-08-10 18:35 by zhangduo2008
[基金申请] 国自然结果 +4 Vierhys 2026-08-10 8/400 2026-08-10 15:06 by Vierhys
[基金申请] 这样的filecode谁见过 +11 布布和一二 2026-08-08 22/1100 2026-08-10 11:10 by wmfsnow
[基金申请] fileCode有新解读? +10 Tide man 2026-08-08 18/900 2026-08-09 12:55 by 仁砚薪传
[基金申请] 关于filecode,很负责任的告诉大家 +6 爱看书的可乐 2026-08-08 7/350 2026-08-08 22:13 by a_niu
[基金申请] 关于豆爷回答的JTJC与%2F数量 +5 yang182083 2026-08-06 7/350 2026-08-08 18:29 by zhanghaozhu
[基金申请] filecode变化情况 +6 布布和一二 2026-08-07 22/1100 2026-08-07 14:45 by 且听虎啸
[基金申请] filecode +8 布布和一二 2026-08-06 11/550 2026-08-06 20:41 by tangpu318
信息提示
请填处理意见