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my1003

铁杆木虫 (著名写手)

[求助] diamond软件生成氢键,怎么单独获取分子间氢键或分子内氢键? 已有2人参与

如题,diamond中会根据设置的键长、键角生成氢键,而不能选择单独获得分子间氢键,请问如何处理?
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仰望星空,脚踏实地!
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sunzan

至尊木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
说一下我的经验,氢键生成之后,分子内、分子间的氢键同时产生,把不需要的部分删掉就可以了,目前还没发现有什么简洁的方法只生成所需要的那一部分氢键。
2楼2014-03-26 08:43:36
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my1003

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by sunzan at 2014-03-26 08:43:36
说一下我的经验,氢键生成之后,分子内、分子间的氢键同时产生,把不需要的部分删掉就可以了,目前还没发现有什么简洁的方法只生成所需要的那一部分氢键。

太多了,很繁琐,工作量太大
仰望星空,脚踏实地!
3楼2014-03-26 12:10:21
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情化钾

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
my1003: 金币+5, ★★★很有帮助, 今天晚上我也发现了这个方法,还是谢谢你 2014-03-26 23:13:34
引用回帖:
3楼: Originally posted by my1003 at 2014-03-26 12:10:21
太多了,很繁琐,工作量太大...

只要知道该删除哪些H键,在右侧table of created bonds中选择要删除的H键删除即可
4楼2014-03-26 15:41:20
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