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farfaraway08

铜虫 (著名写手)

[求助] silicane建模的问题已有2人参与

大家好,最近看文献上有silicane这个材料,看了下它的结构,不知道一般都是怎么进行这种结构模型的建立的,没法查它的结构参数。想请教下版里的高手这样的模型该如何建立。谢谢大家了。

silicane建模的问题
(silicane建模).jpg
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hn19870519

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
farfaraway08: 金币+4, ★★★很有帮助 2014-09-12 16:37:01
1.建立一个石墨烯的模型,两个原子的单胞。
2.手动上下移动原子,安装文献的高度差
3.把碳原子替换成硅原子
4.导出MS的结构,放到vasp中去弛豫。
2楼2014-09-12 11:12:55
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锐利的碎片

木虫 (正式写手)

star watcher

这模型手写也很容易。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
3楼2014-09-12 16:31:58
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farfaraway08

铜虫 (著名写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 锐利的碎片 at 2014-09-12 16:31:58
这模型手写也很容易。

你好,请问怎么手写出原子的位置呀?我是化学方向的,对这个方面真的一点都不懂
4楼2014-09-12 16:36:30
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farfaraway08

铜虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by hn19870519 at 2014-09-12 11:12:55
1.建立一个石墨烯的模型,两个原子的单胞。
2.手动上下移动原子,安装文献的高度差
3.把碳原子替换成硅原子
4.导出MS的结构,放到vasp中去弛豫。

谢谢你,我按照你这个方法试试哈。
5楼2014-09-12 16:36:53
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farfaraway08

铜虫 (著名写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 锐利的碎片 at 2014-09-12 16:31:58
这模型手写也很容易。

你没选择应助,我没法给你金币呀。
6楼2014-09-12 16:37:27
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一谷

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
farfaraway08: 金币+4, ★★★很有帮助, 谢谢。 2014-09-15 14:36:32
1.你可以直接利用石墨烯的模型,将原子替换成Si原子,然后用高精度的几何优化。优化结束后再看看得到的结构。与文献中的对比一下看看。
2.你贴的图上是硅烷,对第一步中得到的结构加氢处理就行了!
食谷长大。。。
7楼2014-09-15 11:06:36
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afan0012

木虫 (小有名气)

图里不是给出来a,b两个矢量了吗。以这两个矢量为坐标轴,就可以把元胞里的原子坐标都表示出来。先确定基矢在直角坐标系下的坐标,原点为(0,0),a和b分别是(1,0),(0.5,0.866);再用基矢平移的方式来确定其他原子的位置。图里面的两个原子位置分别是(1,1);(0.667,0.667),表示沿a,b各平移了一个单位,及沿a,b各平移了2/3个单位。根据简单的几何关系就可以写出来。这是用直接坐标表示的。如果用直角坐标表示,就自己画个直角坐标系,表示出基矢,再用直角坐标表示每个原子的位置。
8楼2014-09-15 16:27:42
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farfaraway08

铜虫 (著名写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by afan0012 at 2014-09-15 16:27:42
图里不是给出来a,b两个矢量了吗。以这两个矢量为坐标轴,就可以把元胞里的原子坐标都表示出来。先确定基矢在直角坐标系下的坐标,原点为(0,0),a和b分别是(1,0),(0.5,0.866);再用基矢平移的方式来确定其他原 ...

谢谢谢谢,我按照你说的做一个试试
9楼2014-09-16 09:39:00
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