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farfaraway08

铜虫 (著名写手)

[求助] silicane建模的问题 已有2人参与

大家好，最近看文献上有silicane这个材料，看了下它的结构，不知道一般都是怎么进行这种结构模型的建立的，没法查它的结构参数。想请教下版里的高手这样的模型该如何建立。谢谢大家了。

silicane建模的问题
(silicane建模).jpg
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1楼 2014-09-12 11:03:23
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hn19870519

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
farfaraway08: 金币+4, ★★★很有帮助 2014-09-12 16:37:01
1.建立一个石墨烯的模型，两个原子的单胞。
2.手动上下移动原子，安装文献的高度差
3.把碳原子替换成硅原子
4.导出MS的结构，放到vasp中去弛豫。
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2楼2014-09-12 11:12:55
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锐利的碎片

木虫 (正式写手)

star watcher
这模型手写也很容易。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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3楼2014-09-12 16:31:58
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farfaraway08

铜虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 锐利的碎片 at 2014-09-12 16:31:58
这模型手写也很容易。

你好，请问怎么手写出原子的位置呀？我是化学方向的，对这个方面真的一点都不懂
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4楼2014-09-12 16:36:30
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farfaraway08

铜虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by hn19870519 at 2014-09-12 11:12:55
1.建立一个石墨烯的模型，两个原子的单胞。
2.手动上下移动原子，安装文献的高度差
3.把碳原子替换成硅原子
4.导出MS的结构，放到vasp中去弛豫。

谢谢你，我按照你这个方法试试哈。
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5楼2014-09-12 16:36:53
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farfaraway08

铜虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 锐利的碎片 at 2014-09-12 16:31:58
这模型手写也很容易。

你没选择应助，我没法给你金币呀。
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6楼2014-09-12 16:37:27
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一谷

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
farfaraway08: 金币+4, ★★★很有帮助, 谢谢。 2014-09-15 14:36:32
1.你可以直接利用石墨烯的模型，将原子替换成Si原子，然后用高精度的几何优化。优化结束后再看看得到的结构。与文献中的对比一下看看。
2.你贴的图上是硅烷，对第一步中得到的结构加氢处理就行了！
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食谷长大。。。
7楼2014-09-15 11:06:36
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afan0012

木虫 (小有名气)
图里不是给出来a,b两个矢量了吗。以这两个矢量为坐标轴，就可以把元胞里的原子坐标都表示出来。先确定基矢在直角坐标系下的坐标，原点为（0，0），a和b分别是(1，0)，(0.5，0.866)；再用基矢平移的方式来确定其他原子的位置。图里面的两个原子位置分别是（1，1）；（0.667，0.667），表示沿a，b各平移了一个单位，及沿a,b各平移了2/3个单位。根据简单的几何关系就可以写出来。这是用直接坐标表示的。如果用直角坐标表示，就自己画个直角坐标系，表示出基矢，再用直角坐标表示每个原子的位置。
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8楼2014-09-15 16:27:42
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farfaraway08

铜虫 (著名写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by afan0012 at 2014-09-15 16:27:42
图里不是给出来a,b两个矢量了吗。以这两个矢量为坐标轴，就可以把元胞里的原子坐标都表示出来。先确定基矢在直角坐标系下的坐标，原点为（0，0），a和b分别是(1，0)，(0.5，0.866)；再用基矢平移的方式来确定其他原 ...

谢谢谢谢，我按照你说的做一个试试
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9楼2014-09-16 09:39:00
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