24小时热门版块排行榜

返回列表

321wangke321

金虫 (正式写手)

应助: 10 (幼儿园)
金币: 343.4
散金: 216
红花: 7
帖子: 517
在线: 287.3小时
虫号: 1169264
注册: 2010-12-13
性别: GG
专业: 园艺作物采后生物学

[求助] 启动子区的转录因子结合位点分析已有1人参与

文中如是说：The promoters of these genes were also enriched in the vCGCGb CAMTA-binding site, suggesting that the CAMTA proteins may directly repress some of the SA-induced genes at warm temperature. The promoters were not enriched in the CBF-binding site, rCCGAC, suggesting that they are not part of the CBF pathway.有些问题想请教各位虫友：

1.如何获得拟南芥中基因的启动子序列，并对转录因子结合位点进行分析？

2.其他物种（有基因组数据）是否也可以进行类似的分析？

谢谢

回复此楼

» 猜你喜欢

生物质超级电容器已经有0人回复
ALK5 高选择性小分子 LY-3200882：可放大合成路线与质控要点解析已经有0人回复
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费? 已经有74人回复
AM630（CAS 164178-33-0）：CB2 选择性配体的实验使用与供应要点已经有0人回复
ADC标杆分子T-DM1全解析：从结构设计到实验室应用的技术要点已经有0人回复
HILIC磁珠研究蛋白组学怎么做？已经有0人回复
His标签蛋白纯化怎么才能快？已经有0人回复
WRN变构抑制剂HRO761：从D1/D2界面锁定到MSI合成致死的工具化合物深度解析已经有0人回复
KRAS G12V(ON) 选择性抑制剂 RMC-5127：从三元复合物机制到科研应用已经有0人回复
SHP2 变构抑制剂 Sitneprotafib：从作用机制到科研试剂选型要点已经有0人回复
PRMT5·MTA 抑制剂 MRTX1719 的科研应用已经有0人回复

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

转录因子结合位点已经有3人回复
请问如何判定是否为启动子序列呢？用什么软件分析？已经有3人回复
一个细胞内大概有多少启动子？（2014/3/30）已经有34人回复
如何查找一段基因序列的启动子？已经有3人回复
TRANSFAC：想要分析转录因子结合位点老板让用 TRANSFAC，求指教已经有8人回复
文献所示启动子区共有结合序列 T K R Y什么意思已经有3人回复

王者风范，一切皆有可能。

1楼 2014-09-07 12:24:25

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

秋雨晗晨

铜虫 (初入文坛)

应助: 2 (幼儿园)
金币: 63.7
帖子: 41
在线: 6.8小时
虫号: 2003314
注册: 2012-09-15
专业: 人类遗传学

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
321wangke321: 金币+20, ★★★★★最佳答案, 谢谢 2014-10-06 20:13:11

你在http://asia.ensembl.org/index.html网站查找该基因，用外显子选项打开其序列，然后在设置里面把编码区上游的片段设到2000，一般起始密码子前面1000左右的包含5‘UTR在内的片段就是主要的启动子区，如果有内含子的话，要去掉。找到序列后，就去一些转库因子结合位点预测的软件上预测一下，像tfsitescan.tess,trrd等等，多几个预测，结合起来就好了。

赞一下(1人)