应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » 审稿意见 关于高通量测序
51/1返回列表
查看: 1664  |  回复: 9
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

yzywlyy

新虫 (小有名气)

[求助] 审稿意见 关于高通量测序 已有1人参与

审稿意见其中一条：
Since the sequencing depth is different across 4 samples, has the dataset been resampling before OTUs assessment? There is no relevant statement about this.

我做实验的四个样本， 其测序深度不同，序列数量不同，测序深度Coverage 也不同（77%，83%，93%，81%).

审稿人的问题是  测序深度不同 是否重新采样来进行OTU 分析。可是我的确没有重新采样。请问各位高手，这个问题如何回答？测序深度77-93%是否达到了分析OTU的要求。是否对后续OTU分析有影响呢

多谢各位
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

分子生物学

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2014-09-04 11:48:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yzywlyy

新虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by litongtongti at 2014-09-08 11:45:22
建议你去了解一下分析的流程，不然后面也很麻烦！...

谢谢您的指点，现在重新分析估计时间来不及了，就快要到期刊给的修改期限。
赞一下 回复此楼
7楼2014-09-09 08:23:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答

litongtongti

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香，分子生物期待你更多精彩。 2014-09-04 18:58:32
yzywlyy: 金币+1, ★★★很有帮助, 多谢 2014-09-07 17:58:17
要把每个样品的序列数都subsample到一样的大小！你去mothur这个wiki百科里看看，讲的很详细！
赞一下 回复此楼
2楼2014-09-04 16:25:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

litongtongti

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香，分子生物期待你更多精彩。 2014-09-04 18:58:40
Coverage不是测序深度，别弄混了
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2014-09-04 16:26:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yzywlyy

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by litongtongti at 2014-09-04 16:25:46
要把每个样品的序列数都subsample到一样的大小！你去mothur这个wiki百科里看看，讲的很详细！

非常感谢您的回复。我大概了解测序深度和文本覆盖率的区别了

由于测序是交给生物公司做的 ，具体程序我也不是很清楚，那审稿人的这个问题如何回答呢？直接回答说the dataset had been resampling before OTUs assessment.可以吗
赞一下 回复此楼
4楼2014-09-07 18:00:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的？ +15 爱看书的可乐 2026-08-26 17/850 2026-08-27 02:00 by xxniao123
[基金申请] 基金不中，共勉 +5 eulota 2026-08-26 5/250 2026-08-26 23:33 by young90
[基金申请] 看板上这么多中的，有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +3 a089 2026-08-26 3/150 2026-08-26 23:21 by young90
[基金申请] 国自然面上复盘~欢迎讨论 +4 晴天加油 2026-08-26 5/250 2026-08-26 21:27 by 木风9012
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +7 process2012 2026-08-23 10/500 2026-08-26 19:23 by hmhminy
[基金申请] 系统查不到 +10 董八千 2026-08-26 10/500 2026-08-26 16:30 by Equinoxhua
[基金申请] 怎么查啊 +5 huang1991js 2026-08-26 5/250 2026-08-26 16:09 by Equinoxhua
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +9 炎黄贵胄 2026-08-22 10/500 2026-08-26 15:40 by semaglutide
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +22 羊腰板 2026-08-21 25/1250 2026-08-26 15:00 by zuocuiping
[基金申请] 哪位高人中了，把查询到的截图贴出来让我看看，让我长长见识 +4 yuleib84 2026-08-26 5/250 2026-08-26 13:40 by yuleib84
[基金申请] 国际合作可查了，中了面上 +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 今天务委会开完了，明天出结果吗 +19 angus9576 2026-08-25 23/1150 2026-08-26 10:03 by zp519
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑，不妨来听听这首《基金之外》 +8 scalable 2026-08-24 8/400 2026-08-25 12:52 by jnhyjjm
[基金申请] 人气不行了 +11 fansofjerry 2026-08-21 11/550 2026-08-25 11:04 by 孤独的英雄6
[基金申请] 我面上完蛋了 +13 且听虎啸 2026-08-20 14/700 2026-08-25 09:10 by mrkang
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +13 kulium 2026-08-21 16/800 2026-08-24 16:27 by superceng
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧？ +4 哈哈蛤？ 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭