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Dearstar

新虫 (小有名气)

[交流] 请教pPIC9载体上xhoI位点明明说是特异性的,为什么分析切得到了二个位置有。。 已有1人参与

pPIC9载体说明上说,载体构建过程中,可供使用的单一限制性内切酶位点为Xho I, SnaB I, EcoR I, Avr II, Not I.

为什么分析了pPIC9的序列却发现二个位置有xho I这个酶切位点, 一个是1192.一个是5709。真心不知道如果以后用xhoI 酶切的时候会怎么样。有没有做过的指导一下。

另外如果我要是选择将我的目的片断插入到pPIC9K中,选择用Ecor I 和 Not I 的话,信号肽酶切位点之后, 到Ecor I的几个氨基酸是怎么去掉的。
小妹初入酵母,还不是特别明白,跪求高手指教啊
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Dearstar

新虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by kehan777 at 2014-08-31 22:02:37
1,信号肽酶切位点之后, 到EcoRI的几个氨基酸是怎么去掉的?
看序列,α-Factor secretion signal(s)(949-1218),EcoRI之前,只后只多出了GTA,这三个碱基,也就是1个AA,应该没什么影响。
2,EcoRI,NotI 双酶切 ...

你好,非常感谢你的回复。
前面是不是多了二三个AA呢,我看好像不止一个呢,还有后面,到TAA还有几个氨基酸,这是怎么去掉的呢,你提醒了我后面也有啊。我是不是应该在我的序列后面加一个终止子呢,因为我的序列是全合成的,直接合成进质粒。为什么说多一二个没有什么关系呢,我的全长也就是一个小肽呢,才四五十个AA。
6楼2014-09-01 09:04:57
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bio_sci

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Dearstar(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-08-29 20:50:08
那就是多了几个氨基酸,避免不了的,有可能有多余的抗原性

[ 发自小木虫客户端 ]
2楼2014-08-29 09:38:48
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happydove

新虫 (小有名气)

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Dearstar(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-08-29 20:50:18
如果选用Ecor I 和 Not I 的话,就会切掉Avr II酶切位点,其他没什么。
载体介绍说是单一酶切位点,如果你构建酵母表达质粒,选用双酶切位点,避开这个酶切位点就可以啦。
3楼2014-08-29 11:27:41
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caihang

铜虫 (小有名气)

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gyesang: 金币+2, 鼓励交流! 2014-08-29 23:51:12
xhoI和sacI酶切位点非常像,不建议用xhoI,因为它是平滑末端,连接效率比粘性末端低很多。
4楼2014-08-29 22:11:09
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