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Dearstar

新虫 (小有名气)

[交流] 请教pPIC9载体上xhoI位点明明说是特异性的,为什么分析切得到了二个位置有。。 已有1人参与

pPIC9载体说明上说,载体构建过程中,可供使用的单一限制性内切酶位点为Xho I, SnaB I, EcoR I, Avr II, Not I.

为什么分析了pPIC9的序列却发现二个位置有xho I这个酶切位点, 一个是1192.一个是5709。真心不知道如果以后用xhoI 酶切的时候会怎么样。有没有做过的指导一下。

另外如果我要是选择将我的目的片断插入到pPIC9K中,选择用Ecor I 和 Not I 的话,信号肽酶切位点之后, 到Ecor I的几个氨基酸是怎么去掉的。
小妹初入酵母,还不是特别明白,跪求高手指教啊
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caihang

铜虫 (小有名气)

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gyesang: 金币+2, 鼓励交流! 2014-08-29 23:51:12
xhoI和sacI酶切位点非常像,不建议用xhoI,因为它是平滑末端,连接效率比粘性末端低很多。
4楼2014-08-29 22:11:09
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bio_sci

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Dearstar(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-08-29 20:50:08
那就是多了几个氨基酸,避免不了的,有可能有多余的抗原性

[ 发自小木虫客户端 ]
2楼2014-08-29 09:38:48
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happydove

新虫 (小有名气)

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Dearstar(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-08-29 20:50:18
如果选用Ecor I 和 Not I 的话,就会切掉Avr II酶切位点,其他没什么。
载体介绍说是单一酶切位点,如果你构建酵母表达质粒,选用双酶切位点,避开这个酶切位点就可以啦。
3楼2014-08-29 11:27:41
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kehan777

木虫 (小有名气)

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Dearstar(西门吹雪170代发): 金币+3, 鼓励回帖交流 2014-09-01 19:22:22
1,信号肽酶切位点之后, 到EcoRI的几个氨基酸是怎么去掉的?
看序列,α-Factor secretion signal(s)(949-1218),EcoRI之前,只后只多出了GTA,这三个碱基,也就是1个AA,应该没什么影响。
2,EcoRI,NotI 双酶切载体,如果XhoI有两个酶切位点(分析确实有),则出现三个条带,一个是很小的条带(舍弃),另外两个是比较大的(两EcoRI之间的,NotI 和EcoRI‘之间),回收两个大条带,然后和你的目的片段(EcoRI,NotI )连接:
如果是三片段同时连接,连接后可能出现“两EcoRI之间的”正向插入,反向插入,没有插入三种情况,可以挑多一两个克隆,先提质粒看条带大小,然后选择符合大小的样品,加设计一条引物测序验证。
5楼2014-08-31 22:02:37
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