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阿修罗Axuro

金虫 (小有名气)

[求助] 十分诡异的电泳问题,困扰太久了,求各位帮忙 已有15人参与

虫子我做DNA电泳接近4年了,从来没失过手,大家可能会想这是一个很简单的实验,怎么会有问题呢?我也是这么想的。所以我师妹出了问题后,我以为很简单就能解决,谁料我亲自上阵,搞了好久问题依旧。真是一世英名毁于这个入门实验手上,晚节不保啊!这不想起了小木虫,特来求助。

言归正传:问题:见图片,不管怎么跑,MARKER都是这个鬼样子,一开始还只有低于500BP的marker出现这样的情况,后面越来越严重,所有的都这样了。

那么问题很简单,我当然不会简单的就来求助,我尝试过哪些解决办法呢?

    一,换电泳Buffer。对师妹不放心,亲自配置新鲜的Buffer,问题依旧。
    二,新买Marker。 这换了Buffer没用,难道Mraker太久了,出问题了?买了俩支新Mraker,一支takara的,一支fermentas的。问题依旧。
    三,新买琼脂糖。 没办法,怀疑琼脂糖有问题,新买了一瓶BIOWEST的琼脂糖。问题依旧。
    四,新买染料。 我们实验室用的是Biotum的gelred,买了大概有大半年了,怀疑染料出了问题,买一支新的。问题依旧。
    五,换电泳仪。 难道电泳仪老化,电压不稳?换另一个一直在跑蛋白偶尔也跑跑中性PAGE的电泳仪(一直正常运行)。问题依旧。
   
神啊,都换得差不多了,还是老样子,这可如何是好?  难道是我加热的姿势不对?微波炉加热和电磁炉加热会有区别吗?明天试试。

十分诡异的电泳问题,困扰太久了,求各位帮忙
20140825.jpg
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君扬1989

铁杆木虫 (著名写手)

怎么感觉像是加了酶,被切成了几段似的呢?拖尾很严重,浓度过高?还是琼脂糖浓度不适合?
2楼2014-08-26 21:14:21
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ssssllllnnnn

至尊木虫 (知名作家)

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
阿修罗Axuro(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-08-27 19:05:55
阿修罗Axuro: 金币+25, ★★★很有帮助, 已经解决,虽然不是Marker量的问题,但是从这里入手解决的。 2014-08-28 16:06:21
用了多少DNA跑的胶?用量太大了。每孔用100 ng左右就差不多了(取决于你孔的大小)。
我的感觉是严重超量所致,不是其他什么大问题。
3楼2014-08-26 23:26:46
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yypyy

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
感觉像是胶没溶好,以前我也偶尔遇见过这种情况~

[ 发自小木虫客户端 ]
4楼2014-08-26 23:30:22
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朽木~~

新虫 (初入文坛)

果断制胶的问题,
5楼2014-08-27 01:25:05
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douglaspei

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
阿修罗Axuro(西门吹雪170代发): 金币+2, 鼓励回帖交流 2014-08-27 19:06:12
阿修罗Axuro: 金币+5, 有帮助, 谢谢热心帮助 2014-08-28 16:07:03
从电泳图看像是上样量过高。如果降低上样量仍不能解决问题,建议调整电泳条件(电流<80A)。如果仍不行,建议检查一下电泳槽的铂金丝。祝好运!

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
6楼2014-08-27 07:20:34
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阿修罗Axuro

金虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by ssssllllnnnn at 2014-08-26 23:26:46
用了多少DNA跑的胶?用量太大了。每孔用100 ng左右就差不多了(取决于你孔的大小)。
我的感觉是严重超量所致,不是其他什么大问题。

请注意看完我的问题,我的问题是Marker是模糊的,不是DNA条带问题。Marker我一般加5ul。
7楼2014-08-27 08:48:53
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阿修罗Axuro

金虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by yypyy at 2014-08-26 23:30:22
感觉像是胶没溶好,以前我也偶尔遇见过这种情况~

我怀疑过胶没熔好,然后我试过各种熔,熔很久都试过,而且我做胶四年了,从来没遇到过这个问题,不至于以前都能熔好,忽然就熔不好了。
8楼2014-08-27 08:49:55
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阿修罗Axuro

金虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by douglaspei at 2014-08-27 07:20:34
从电泳图看像是上样量过高。如果降低上样量仍不能解决问题,建议调整电泳条件(电流<80A)。如果仍不行,建议检查一下电泳槽的铂金丝。祝好运!

请注意我提的问题,我提出的问题不是关于DNA条带的,而是关于Marker的。我试过降低电压,无效。铂金丝看了,外观上没有明显发现,电泳时铂金丝上也一样的冒气泡,没有发现不正常现象。铂金丝有问题的话,要么不通电,要么就是通电低,能有什么问题呢?
9楼2014-08-27 08:52:05
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阿修罗Axuro

金虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 朽木~~ at 2014-08-27 01:25:05
果断制胶的问题,

请讲述原因,我做胶是0.2g 琼脂糖加20ml TAEbuffer,于微波炉中加热至沸腾,然后拿出来,摇匀,再加热至沸腾,再摇匀,再加热至沸腾再摇。就是沸腾3次。而且4年来我都如此做,从未有这个问题。一开始师妹按我的做,也没有任何问题,后来才出来问题的。
10楼2014-08-27 08:54:22
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