| 查看: 2295 | 回复: 7 | ||
panger金虫 (小有名气)
|
[求助]
VMD作图时的问题 已有1人参与
|
| 用Multiwfn做过拓扑学分析以后，导出鞍点和键径的pdb文件，在处理鞍点的颜色时VDM的Graphics-Representation里面的Selected Atoms输入name C为什么选择的结果是全部原子？难道VDM只能区别不同类型的鞍点？不能区分原子？我做的是亚硝酸甲酯，不同原子怎么选择？键鞍点的颜色又怎么选择？望高手解答，谢谢。 |
回复此楼» 猜你喜欢
国家大人才课题组招收化学、材料化工类2026年调剂生
已经有0人回复
-
淮北师范大学 化学与化工科学学院2026年硕士研究生招生 调剂信息公告
已经有1人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有286人回复
-
淮北师范大学 化学与化工科学学院 电催化课题组还有1名硕士研究生招生名额
已经有0人回复
-
化学相关硕士研究生招收调剂-湖北师范大学 （快来捡漏，最新调剂信息，过国家线即可）
已经有1人回复
-
河南理工大学化学化工学院招收学硕调剂生
已经有0人回复
-
黑龙江科技大学化工 环境工程调剂
已经有22人回复
-
莆田学院环境与生物工程学院资源与环境专硕（环境工程方向） 开放调剂招生
已经有12人回复
-
浙江海洋大学石油化工与环境学院招收工科调剂生（学硕、专硕均可，线上面试）
已经有0人回复
-
浙江海洋大学石油化工学院接收工科调剂（学硕、专硕均可，近期线上面试）
已经有8人回复
-
浙江海洋大学石油与天然气工程专业接收工科调剂（13日早上截止，线上面试）
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- matlab作图问题
已经有9人回复
- sigmaplot作图问题
已经有3人回复
- orig作图横坐标问题
已经有7人回复
- matlab作图问题
已经有5人回复
- origin作图的问题，都是锯齿
已经有9人回复
- 【急】求大神解决Linux终端显示问题：vmd、i2打不开
已经有5人回复
- 关于静电势的强弱问题？
已经有12人回复
- 关于origin8.1作图的横坐标时间表示问题
已经有5人回复
- PYMOL与VMD作图的区别
已经有11人回复
- 关于VMD可视化的问题
已经有5人回复
- 关于Matlab作图的问题
已经有14人回复
- sigmaplot作图中横坐标的问题，谢谢
已经有3人回复
- 大家帮忙看看VMD安装过程中出现的问题！~
已经有8人回复
- Excel作图问题
已经有6人回复
- 关于拉曼光谱作图出现的问题
已经有9人回复
- 【讨论】用VMD作的RDF图片不知有没有问题
已经有16人回复
- 【求助】origin7.5作图的问题
已经有5人回复
- 【分享】分子模拟中作图和看轨迹的软件vmd windows版下载及使用手册
已经有13人回复
sobereva
至尊木虫 (著名写手)
本人已永久离开小木虫
- QC强帖: 17
- 应助: 226 (大学生)
- 贵宾: 5.4
- 金币: 2180.5
- 红花: 217
- 帖子: 1241
- 在线: 366.8小时
- 虫号: 281271
- 注册: 2006-09-23
- 专业: 宇宙学
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zhou2009: 金币+5 2014-08-25 20:01:19
panger: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2014-08-25 22:59:11
感谢参与，应助指数 +1
zhou2009: 金币+5 2014-08-25 20:01:19
panger: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2014-08-25 22:59:11
|
先确认你已经找出了各种类型的临界点，并且载入到VMD里的是Multiwfn输出的CPs.pdb。 CPs.pdb里，C/N/O/F分别对应(3,-3)/(3,-1)/(3,+1)/(3,+3)型临界点。因此你要显示比如(3,-1)，selected atoms里就输入name C，如果要显示(3,+3)，就输入name F 若修改临界点的颜色，把Coloring method设为Color ID，选择相应的颜色即可 此帖有详细说明，建议你先做做文中的例子 Multiwfn结合VMD绘制AIM拓扑分析图 http://hi.baidu.com/sobereva/item/40c03f072667a931a3332a8e |
2楼2014-08-25 18:41:20
panger
金虫 (小有名气)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 2759.5
- 红花: 1
- 帖子: 62
- 在线: 92.9小时
- 虫号: 815411
- 注册: 2009-07-25
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
3楼2014-08-25 22:59:59
panger
金虫 (小有名气)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 2759.5
- 红花: 1
- 帖子: 62
- 在线: 92.9小时
- 虫号: 815411
- 注册: 2009-07-25
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
4楼2014-08-25 23:20:48
sobereva
至尊木虫 (著名写手)
本人已永久离开小木虫
- QC强帖: 17
- 应助: 226 (大学生)
- 贵宾: 5.4
- 金币: 2180.5
- 红花: 217
- 帖子: 1241
- 在线: 366.8小时
- 虫号: 281271
- 注册: 2006-09-23
- 专业: 宇宙学
5楼2014-08-26 03:41:57
sobereva
至尊木虫 (著名写手)
本人已永久离开小木虫
- QC强帖: 17
- 应助: 226 (大学生)
- 贵宾: 5.4
- 金币: 2180.5
- 红花: 217
- 帖子: 1241
- 在线: 366.8小时
- 虫号: 281271
- 注册: 2006-09-23
- 专业: 宇宙学
6楼2014-08-26 03:43:35
panger
金虫 (小有名气)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 2759.5
- 红花: 1
- 帖子: 62
- 在线: 92.9小时
- 虫号: 815411
- 注册: 2009-07-25
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
7楼2014-08-26 10:02:04
8楼2015-12-24 09:45:47
