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mikesnow

铁虫 (初入文坛)

[求助] 关于拉曼光谱作图出现的问题

大家好!
我在用高斯计算激发光共振拉曼效应的时候,出现如下问题:
1.在高斯输入文件加入一定波长的光,然后计算拉曼光谱。计算结果:在频率下方对应的Raman activity数据全部是*********(星号),这是为什么?
2.我将输出文件(.log)用GV打开查看result中的Raman光谱,全部是0。
3. 到此,我以为计算得到的raman activity是0.但是我将输出文件用swizard软件转化,结果得到的absorbance数值非常大,然后也得到每个峰对应的intensity,这个数值和我预期的很相似,但是我无法用这组数据作图(因为这个数值不是连续的,只是101频率对应的intensity)。
请问高手们,我这个到底是什么问题?****是说超出高斯的范围吗?想要做Raman spectra,纵轴是intensity,除了直接从GV中导出数据,还有其他的方法吗?
恳请高手指点。
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拉曼光谱

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狼外婆

金虫 (著名写手)

贴命令看下
2楼2011-05-25 16:54:36
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mikesnow

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
Originally posted by mikesnow at 2011-05-24 16:32:26:
大家好!
我在用高斯计算激发光共振拉曼效应的时候,出现如下问题:
1.在高斯输入文件加入一定波长的光,然后计算拉曼光谱。计算结果:在频率下方对应的Raman activity数据全部是*********(星号),这是为什么 ...

#P B3LYP/gen freq=raman cphf=rdfreq Pseudo=read                  
                                                                 
C17H12O6                                                     
                                                                 
0 2                                                              
C                  3.62040700    0.28069600   -0.04281300      
C                  2.52857200   -0.59151700    0.12425800      
C                  3.49108100    1.65876200   -0.15479900      
C                  1.26220500   -0.04781300    0.20590400      
C                  1.05834200    1.35458400    0.07734700      
C                  2.20325200    2.19006400   -0.09489500      
C                 -0.29796800    1.80149000    0.14023600      
C                 -1.32315400    0.90621200    0.33775700      
.................

H                  3.44067900   -1.88288700    1.47792600                     
H                  4.18210800   -1.71818000   -1.47188100                     
Ag                -4.59719500   -1.32206400   -0.31957600                     
                                                                              
351 nm                                                                        
                                                                              
C H O 0                                                                        
6-311G**                                                                     
****                                                                          
这是输入文件的一部分,加入的是351nm的入射光。

计算后的:
                   88                     89                     90              
                                  A                      A                      A              
Frequencies --  1662.0619              1727.5161              1801.5352         
Red. masses --     9.2745                12.7985                13.0228         
Frc consts  --    15.0951                22.5037                24.9023         
IR Inten    --   286.4938                75.6825                92.4899         
Raman Activ -- 10413.5571           45694.6912            151740.4662         
Depolar (P) --     0.3571                 0.3410                 0.3399         
Depolar (U) --     0.5263                 0.5086                 0.5074         
RamAct Fr= 1-- 10413.5571          45694.6912            151740.4662         
Dep-P Fr= 1--     0.3571                 0.3410                 0.3399         
Dep-U Fr= 1--     0.5263                 0.5086                 0.5074         
RamAct Fr= 2--***********       ***********           ***********         
Dep-P Fr= 2--     0.3333                 0.3333                 0.3333         
Dep-U Fr= 2--     0.5000                 0.5000                 0.5000         
Atom  AN      X      Y      Z        X      Y      Z        X      Y      Z     
    1   6    -0.09   0.30  -0.01    -0.01  -0.02   0.00    -0.01   0.01   0.00   
    2   6     0.36  -0.25   0.01     0.03   0.00   0.00     0.07  -0.03   0.00   
    3   6     0.20  -0.31   0.01     0.01   0.00   0.00     0.02  -0.01   0.00
上面是输出文件的一部分,请问这是什么问题啊?谢谢!
3楼2011-05-25 17:02:34
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狼外婆

金虫 (著名写手)

Raman Activ -- 10413.5571           45694.6912            151740.4662
这个不是拉曼活性吗?不是特别懂。
4楼2011-05-25 21:12:13
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mikesnow

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
Originally posted by 狼外婆 at 2011-05-25 21:12:13:
Raman Activ -- 10413.5571           45694.6912            151740.4662
这个不是拉曼活性吗?不是特别懂。

这个 Raman Activ -- 以及RamAct Fr= 1--  是static的拉曼活性(普通或常规的拉曼活性),
而 RamAct Fr= 2--***********        ***********         ***********应该是加入预共振的激发光以后的共振拉曼活性,现在此活性成为了*******,我想问的是:为什么会这样?谢谢!
5楼2011-05-25 21:33:37
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mikesnow

铁虫 (初入文坛)

麻烦高手帮帮忙吧!!是软件的问题还是我计算中的问题?有没有朋友遇到过类似的问题啊?
6楼2011-05-26 16:47:51
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hlma_ustc

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


mikesnow(金币+10): 2011-09-29 15:23:32
个人认为是软件的问题,因为共振拉曼活性一般都是非常大的。这个与入射波长有关。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

7楼2011-07-12 18:51:48
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mikesnow

铁虫 (初入文坛)

送鲜花一朵
引用回帖:
Originally posted by hlma_ustc at 2011-07-12 18:51:48:
个人认为是软件的问题,因为共振拉曼活性一般都是非常大的。这个与入射波长有关。

是的,现在几乎可以确定是软件的问题。谢谢你!
我不知道怎么给你金币。
8楼2011-07-22 15:58:50
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mikesnow

铁虫 (初入文坛)

我不知道如何给回答过我问题的朋友金币,知道的请提示我一下。这个是诚信问题,我想能尽快解决。
9楼2011-09-07 10:20:32
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cindy-度假

新虫 (初入文坛)

楼主,关于用gaussian计算预共振拉曼我也出现过过这个问题,也在寻求解决的办法,请问楼主找到解决的办法了吗?分享一下
10楼2016-02-16 20:28:57
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