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白若薇

新虫 (正式写手)

[求助] 求助 虫友们 帮解决【定量PCR】 问题。

本人最近在做定量PCR过程中,出现了如下图中所出现的问题一些,望各位虫友帮忙解决一下,谢谢!。总结下来有:
1) 本人使用的生工编号:SK2957A(SGExcel UltraSYBR Mixture)试剂盒,运用的是一步定量PCR方法,每次跑提取质粒的各稀释倍数做标准曲线,很不错,扩增效率能保证在100%左右,R2基本上也能控制在0.95到1之间。
反应体系是:SYBR MIX+Primer1+Primer2+DNA Template+ ddH2O=12.5+0.5+0.5+2+9.5=25ul
反应条件是:见附图。
2)但是,每次做阴性对照(即以ddH2O为模板)时,总有扩增出现,Ct值出现在33-37之间。
3)样品DNA稀释10倍上样,扩增Ct重复性很差,并不像标线一样,重复性很好,而且溶解曲线温度和标线温度很不同。标线样品的溶解温度基本都是86度,而样品溶解温度都是78-84之间,是不是就说明没有扩增出目的片段啊?

下图附上昨天晚上刚做的一次实验结果图谱。
图中蓝色线是未知样品,绿色是标样,红色是阴性对照。




求助 虫友们 帮解决【定量PCR】 问题。
标线-扩增曲线.png


求助 虫友们 帮解决【定量PCR】 问题。-1
反应条件.png


求助 虫友们 帮解决【定量PCR】 问题。-2
溶解曲线-2.png
求助 虫友们 帮解决【定量PCR】 问题。-3
扩增曲线-1.png


求助 虫友们 帮解决【定量PCR】 问题。-4
溶解曲线-1.png
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