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蠢蠢欲动

金虫 (小有名气)

[求助] 高分急求!动力学模拟可以从轨迹中提取到哪些热力学数据?? 已有2人参与

用gromacs做的动力学模拟,可以从轨迹中提取到哪些热力学数据呢??
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匿名

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2楼2014-08-18 09:20:11
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蠢蠢欲动

金虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by zhihaikou at 2014-08-18 09:20:11
可以根据轨迹,利用统计方法计算出来速度 温度 压力等热力学数据

谢谢。能量方面的可以得到有哪些呢?
3楼2014-08-18 09:22:01
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匿名

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4楼2014-08-18 09:24:49
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jxgjls

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

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根据系综原理,有了配分函数理论上可以计算几乎所有的热力学量,U、delta U、G、delta G、delta delta G等等,但由于在计算机里采样难以充分,算不准熵变值,所以很多的热力学量的值连同具体的计算方法都有其适用范围。
5楼2014-08-18 17:00:17
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