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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 如何根据氨基酸改变找到对应的核苷酸改变？
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waterxia

金虫 (小有名气)

[求助] 如何根据氨基酸改变找到对应的核苷酸改变？已有2人参与

在一篇1996年的文献中看到ATP7B基因的p.Arg778Gln突变，对应的核苷酸改变为G2273A。但现在数据库中p.Arg778Gln突变对应的核苷酸改变为c.2333G>A。没能找到这个突变的rs号，那么怎么确认文献中说的G2273A就是c.2333G>A呢？求大神指导啊！多谢！
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加油哦~
1楼2014-08-07 09:17:39
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waterxia

金虫 (小有名气)
对于这一类问题，应该以氨基酸改变为根据来反推核苷酸改变。因为核苷酸改变的命名可能因人而异，但是同一转录本上的氨基酸位数却是固定不变的。所以应该根据氨基酸位置反推密码子上核苷酸改变的位点。
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加油哦~
5楼2015-02-28 09:59:42
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
可能是文献中和数据库中用的序列长度不同，编码位置有差异，所以突变位点标示不同。
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2楼2014-08-07 12:32:57
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waterxia

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by stone2239 at 2014-08-07 12:32:57
可能是文献中和数据库中用的序列长度不同，编码位置有差异，所以突变位点标示不同。

有其他的文献引用了这篇文献，并且提出p.Arg778Gln突变对应的核苷酸改变为c.2333G>A。但是不知道人家是怎么对应过来的
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加油哦~
3楼2014-08-07 13:34:22
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happydove

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
你把文献上的序列和数据库的序列比对一下，不可以吗
如果不可以，你可以写信给作者
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4楼2014-08-07 15:52:44
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