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转基因猴子木虫 (正式写手)
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[求助]
求助，是否有哪个蛋白质三维软件可以特定改变某个氨基酸的某个基团
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| 本人想通过软件改变某个特定氨基酸的某个基团，比如说，我想改变某个位点的Lys的氨基，将其变为羟基，有软件可以做到这一点吗？如何做的呀？PDBviewer pymal VMD能做吗？请高手解答。50金币送上.如能指导我顺利做出，有更多金币送上。 |
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qianxiong
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【答案】应助回帖
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chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2013-01-21 08:17:07
转基因猴子: 金币+20 2013-01-21 13:51:38
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转基因猴子: 金币+20 2013-01-21 13:51:38
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举个例子。4dxd.pdb 175号残基lys 的原子坐标如下： ATOM 1133 N LYS A 175 4.266 20.656 -0.448 1.00 24.26 N ATOM 1134 CA LYS A 175 5.425 19.788 -0.168 1.00 24.34 C ATOM 1135 C LYS A 175 6.681 20.530 0.331 1.00 28.17 C ATOM 1136 O LYS A 175 7.509 19.928 1.005 1.00 28.22 O ATOM 1137 CB LYS A 175 5.745 18.901 -1.381 1.00 25.70 C ATOM 1138 CG LYS A 175 4.648 17.890 -1.613 1.00 25.52 C ATOM 1139 CD LYS A 175 4.955 16.904 -2.714 1.00 28.78 C ATOM 1140 CE LYS A 175 3.767 15.995 -2.930 1.00 33.76 C ATOM 1141 NZ LYS A 175 3.995 15.043 -4.046 1.00 46.97 N 把 1141 的NZ改成如下 ATOM 1141 O LYS A 175 3.995 15.043 -4.046 1.00 46.97 O 然后你用一些软件加氢，就将氨基改成了羟基。但是这种改变是否有科学依据？你需要自己判断。 |
3楼2013-01-20 21:56:34
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