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su2376053

新虫 (小有名气)

[求助] NEB的计算中一般选取几个image? 已有3人参与

在NEB的计算中一般设定几个image,选取原则是什么?有什么参考文献能说明这个问题?
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liliangfang

荣誉版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
这个不好说的吧,一般有你自己确定的啊,看你像要几个中间状态。一般方便计算试算的时候选5个就可以了。参考文献一般都木有说明的哦
2楼2014-08-06 07:37:03
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kjsun

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
具体选几个image是根据你计算体系不同而不同的,因此说明书不能给你太多建议。
选image多少大致的原则是跟反应路径的长度和复杂度(弯曲程度)有关
反应路径越长(初态结构到末态结构的直接位移越大),image越多。
反应路径越复杂(从初态到末态除了平移之后,还包含旋转等),image越多。
比较简单的反应路径,比如只是某个原子或分子的平移(扩散),5-7个images够了,复杂一点的就需要更多了,不能一概而论。
  
五年多没用NEB了(因为我是急脾气,NEB太慢,被我无情抛弃了),不知道我5年前的经验是否现在还适用,也不知道现在的NEB是不是快了许多。
3楼2014-08-06 08:59:14
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xiaohaiyi

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2014-08-07 07:44:00
一般最少选5个,算算看,算了一部分结果再修改
4楼2014-08-06 22:36:57
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huangpan

金虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by kjsun at 2014-08-06 08:59:14
具体选几个image是根据你计算体系不同而不同的,因此说明书不能给你太多建议。
选image多少大致的原则是跟反应路径的长度和复杂度(弯曲程度)有关
反应路径越长(初态结构到末态结构的直接位移越大),image越多 ...

请问同学用的是什么方法来搜索过渡态呢?
5楼2015-04-24 09:41:21
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kjsun

木虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by huangpan at 2015-04-24 09:41:21
请问同学用的是什么方法来搜索过渡态呢?...

我算的体系大,动不动就是几百个原子
要算的过渡态又多,随便几个反应路径就几十个过渡态要算。
计算资源又不行,
实在跑不了NEB,
万般无奈的情况下,自己写了个找过渡态的程序。

如果计算量小,或者过度态少,或者富豪,有的是计算资源,还是建议用NEB.

NEB省心啊。
6楼2015-04-24 11:54:25
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