24小时热门版块排行榜    

查看: 1947  |  回复: 17
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

linzshit

银虫 (小有名气)

[求助] 如何鉴定一种DNA样本中的不同样本类型所占百分比 已有3人参与

现在遇到一个技术难点,举个例子就是我混合两种不同的质粒A和B,质粒之间只存在一个点的差别,我用定量的方式确定两种质粒的浓度,然后进行混合,混合方式为A/(A+B)=5%,这里的百分比是浓度比。现在问题来了,对于混合后的样本,我想鉴定它到底是不是按我预想的混合成5%了,有什么方法吗?希望大神能够解答,谢谢
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

柠萌粉

铜虫 (正式写手)

引用回帖:
15楼: Originally posted by linzshit at 2014-07-31 11:10:07
这种的我也试过,甚至试过通过最后的峰高、Ct值、扩增效率去推算初始模板量,不过感觉出入还是挺大的。
我想两种质粒的话一个点突变的区别,通过定量得到浓度然后去混合,这种混合结果应该是普遍被认可是正确的吧 ...

我也有过这种需求,所以当初也想了一些办法,最后还是放弃了,我是发现了某基因的两种转录本,也是SNP的差别,想确定他们之间拷贝数的比值
16楼2014-07-31 13:07:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 18 个回答

songzuowei

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
linzshit(myprayer代发): 金币+1, 赠人玫瑰手有余香,分子生物期待你更多精彩。 2014-07-29 11:53:10
大神的不是 可以做soutern blot
2楼2014-07-28 14:33:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

柠萌粉

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
linzshit(myprayer代发): 金币+1, 赠人玫瑰手有余香,分子生物期待你更多精彩。 2014-07-29 11:53:18
southern探针都比较长,单个碱基突变似乎不好做
可以试试看QPCR的方法,把突变点设置为3'最后一个碱基
A引物扩增B的 B引物扩增A的 看看能否达到区分效果(看ct值差别大不大。。)
如果质粒量比较足的话,还可以试试酶切。。
不是大神的路过
3楼2014-07-28 18:34:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

linzshit

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by songzuowei at 2014-07-28 14:33:14
大神的不是 可以做soutern blot

southern的话是如何做到定量的啊,我需要精确定量到5%,这个能实现吗?
4楼2014-07-29 09:16:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
信息提示
请填处理意见