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hajierlove

铜虫 (正式写手)

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专业: 生态学

[求助] 求助，引物设计已有3人参与

ATGAACCTACCTCAAGTTTCACCCTTCCAACCATTTTCCAAGGAAGAGCA
GTTGACAAGGATCAAGAAAATGAACGAAGAAGTGGAACCATTCCGCAAGA
ATCTCACCGAATGCGCACACCAGGTCAAAGCGAAAGCGACAGATGTGGAG
GATTTCCTGAAAAGAATACCACAGTCAACTGCTCAAGGGAAATGCTTCGT
CGCGTGCATTCTCAAAAGAAACGAGTTGATAAAAAACAACAAAATACAGA
AGGAAAGCCTCATAGAAGTTAATCGGGCAGTGTATGGAGACGACAGCGAG
GTCATGGCCCGCCTGAAGACAGCCATAATTGAATGCGAAGAGGTGGTATC
CGACATATTTGAGATTTGCGAGTATGCATCCATGTTTAATGACTGTATGC
ATATGAAAATGGAACATATTCTCGACAAAGTGACTATGGATAGGAGGATG
AAAGCCCTCGGACAGATGGCATCGGCCGACGCTTATACGGACGATTGGAC
TGAAGATGACGATGAAATATTACAATTGCTTAAAGACGAACTATAA

序列如上图，设计了几对引物，都扩不出来，将来要进行原核表达。精通引物设计的虫虫们，一起交流一下吧，新手，金币有限，海涵。谢谢啦

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踏实

1楼 2014-07-17 11:50:10

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

未婚

金虫 (正式写手)

分子小生

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专业: 动物遗传学

【答案】应助回帖

引用回帖:

9楼: Originally posted by hajierlove at 2014-07-17 19:59:27
楼主帮我再看看下面的序列，我感觉很多问题
1、cds序列起始的怎么不是起始密码子。
2、scaffold上面也是以他起始的，往前移一段也不行。
3、3‘端发夹真的没影响吗？...

起始密码自不一定都是ATG的原核的有TAA TAG的不过我怎么看你的上面那段都不像是有起始密码的确定找对位置了么？