| 查看: 2323 | 回复: 11 | ||||
[求助]
生物信息学分析 已有3人参与
|
||||
| 求教有关酶基因的生物信息学分析的流程及方法，越详细越好，我对这方面不是很通。虽然金币少了点，不过等我下次攒多了再多发点，多谢多谢，感激不尽。 |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 生物信息学 |
» 猜你喜欢
蛋白质检测：精准分析，解锁生物分子的密码
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之小鼠实验：严谨设计，解析生命机制的重要载体
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有265人回复
-
不合理蛙科研实验之重金属检测：精准筛查，守护健康与环境的防线
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“蛙测重金属我背锅三千”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“鼠逃三次我发三篇SCI”
已经有0人回复
-
纳米粒度分析
已经有3人回复
-
林科院林化所招收材料与化工专业硕士，坐标南京
已经有0人回复
-
留学--博士招生
已经有15人回复
-
化学工程，本211，求调剂，ab区不限
已经有4人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 求人写个程序，生物信息学分析方面的要求用perl或者python来写！
已经有5人回复
- 计算生物学/生物信息学对数学的要求很高吗？
已经有5人回复
- 生物信息学分析
已经有4人回复
- 如何学好生物信息学
已经有10人回复
- 请教如何学习生物信息学
已经有9人回复
- 关于基因的生物信息学分析
已经有4人回复
- 生物信息学分析
已经有5人回复
- 求助有关生物信息学的
已经有13人回复
- 求助分析蛋白的生物信息学分析方法
已经有8人回复
- 有人了解北京有比较棒的做生物信息学分析的小组么？要做二代测序分析，求推荐~~~
已经有22人回复
凌波丽
专家顾问 (知名作家)
-
专家经验: +218 - MolEPI: 44
- 应助: 397 (硕士)
- 贵宾: 0.044
- 金币: 2118.9
- 散金: 10
- 红花: 208
- 帖子: 5633
- 在线: 571.6小时
- 虫号: 1766465
- 注册: 2012-04-19
- 性别: MM
- 专业: 生物大分子结构与功能
- 管辖: 生物科学综合
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★
930111(西门吹雪170代发): 金币+5, 鼓励回帖交流 2014-07-09 09:32:23
930111(西门吹雪170代发): 金币+5, 鼓励回帖交流 2014-07-09 09:32:23
|
实际上预测真核基因的结构有很多种预测方法和免费的网站。 具体请参见： 薛庆中 等编著，DNA和蛋白质序列数据分析工具，科学出版社，2012，第三版，25-39，第2章 真核基因结构的预测，其中有GENSCAN（针对基因组ＤＮＡ序列预测可读框和基因结构）: http://genes.mit.edu/GENSCAN.html 的操作介绍，还有CpGplot（CpG岛预测）: http://www.ebi.ac.uk/emboss/cpgplot/index.html ,PromoterScan（启动子区域i预测）: http://www-bimas.cit.nih.gov/molbio/proscan 的介绍。也介绍了 用软件CodonW 计算基因密码子偏好性，CodonW 能够在Windows系统下运行，可以从http://codonw.sourcerforge.net 下载。 基因功能分类可以用Gene Ontology : http://www.geneontology.org 进入界面后在基因功能数据库中搜索目的基因可能的生物学功能，或者特定的生物学功能有哪些基因可能参与。还可以到 Genecards 数据库去查询 感兴趣的基因的功能，Genecards http://www.genecards.org . 生物信息学参考书： 1.DNA和蛋白质序列数据分析工具(第二版)PDF http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=6358121&fpage=1&target=blank 下载后即可阅读。 2.DNA和蛋白质序列数据分析工具_(第三版） http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=7614763&fpage=1&target=blank 下载后好像无法解压，楼主试试看吧，至少“DNA和蛋白质序列数据分析工具(第二版)”肯定能够用。 “DNA和蛋白质序列数据分析工具(第二版)”都是讲的生物信息学数据库和生物信息学软件的具体应用，很容易看懂并且自己上手操作，不过没有讲述各种算法的原理。 如果要更深入学习生物信息学，建议学习： 1.Pierre Baldi etal.,Bioinformatics------the Machine Learning Approach,MIT press,2001,千万不要看该书的翻译版本，翻译版烂的难以想象，翻译版就连条件概率的公式的含义都不知道怎么解释！下载：http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1038227&fpage=1&target=blank 2.M.Zvelebil ,J.O.Baum 著（2008），李亦学、郝沛 主译，理解生物信息学，科学出版社，2012，这本书的英文原版，我还没有见过，此书内容丰富，解析详细，但是让人非常不爽的是全书所有的数据库和软件下载处均未在正文中给出具体网址，而是每章末的参考文献中给出带有具体网址的SCI文献。 3.李霞、李亦学 主编，生物信息学学习指导与习题集，人民卫生出版社，2011，现在大陆唯一的一本生物信息学习题解答，包括上机题目中不少也有文字版本的具体解答。 4.M.Michael Gromiha,Protein Bioinformatics:From Sequence to Function,Elsevier,2001. 就先说这些吧，意见仅供参考。 |
11楼2014-07-09 01:40:48
Titanic416
银虫 (知名作家)
北京方便面真方便
- 应助: 101 (高中生)
- 金币: 14.4
- 散金: 6139
- 红花: 186
- 沙发: 79
- 帖子: 8456
- 在线: 698.7小时
- 虫号: 2333330
- 注册: 2013-03-09
- 专业: 环境微生物学
2楼2014-07-07 23:52:00
3楼2014-07-08 08:18:10
Titanic416
银虫 (知名作家)
北京方便面真方便
- 应助: 101 (高中生)
- 金币: 14.4
- 散金: 6139
- 红花: 186
- 沙发: 79
- 帖子: 8456
- 在线: 698.7小时
- 虫号: 2333330
- 注册: 2013-03-09
- 专业: 环境微生物学
4楼2014-07-08 12:20:28
5楼2014-07-08 22:54:03
Titanic416
银虫 (知名作家)
北京方便面真方便
- 应助: 101 (高中生)
- 金币: 14.4
- 散金: 6139
- 红花: 186
- 沙发: 79
- 帖子: 8456
- 在线: 698.7小时
- 虫号: 2333330
- 注册: 2013-03-09
- 专业: 环境微生物学
9301116楼2014-07-08 23:36:55
7楼2014-07-08 23:53:00
Titanic416
银虫 (知名作家)
北京方便面真方便
- 应助: 101 (高中生)
- 金币: 14.4
- 散金: 6139
- 红花: 186
- 沙发: 79
- 帖子: 8456
- 在线: 698.7小时
- 虫号: 2333330
- 注册: 2013-03-09
- 专业: 环境微生物学
8楼2014-07-09 00:03:19
凌波丽
专家顾问 (知名作家)
-
专家经验: +218 - MolEPI: 44
- 应助: 397 (硕士)
- 贵宾: 0.044
- 金币: 2118.9
- 散金: 10
- 红花: 208
- 帖子: 5633
- 在线: 571.6小时
- 虫号: 1766465
- 注册: 2012-04-19
- 性别: MM
- 专业: 生物大分子结构与功能
- 管辖: 生物科学综合
9楼2014-07-09 00:42:08
凌波丽
专家顾问 (知名作家)
-
专家经验: +218 - MolEPI: 44
- 应助: 397 (硕士)
- 贵宾: 0.044
- 金币: 2118.9
- 散金: 10
- 红花: 208
- 帖子: 5633
- 在线: 571.6小时
- 虫号: 1766465
- 注册: 2012-04-19
- 性别: MM
- 专业: 生物大分子结构与功能
- 管辖: 生物科学综合
10楼2014-07-09 00:47:10
