24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 2361  |  回复: 11

凌波丽

专家顾问 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
930111(西门吹雪170代发): 金币+5, 鼓励回帖交流 2014-07-09 09:32:23
实际上预测真核基因的结构有很多种预测方法和免费的网站。
具体请参见:
薛庆中 等编著,DNA和蛋白质序列数据分析工具,科学出版社,2012,第三版,25-39,第2章 真核基因结构的预测,其中有GENSCAN(针对基因组DNA序列预测可读框和基因结构): http://genes.mit.edu/GENSCAN.html  的操作介绍,还有CpGplot(CpG岛预测): http://www.ebi.ac.uk/emboss/cpgplot/index.html  ,PromoterScan(启动子区域i预测): http://www-bimas.cit.nih.gov/molbio/proscan  的介绍。也介绍了 用软件CodonW 计算基因密码子偏好性,CodonW 能够在Windows系统下运行,可以从http://codonw.sourcerforge.net  下载。
基因功能分类可以用Gene Ontology : http://www.geneontology.org  进入界面后在基因功能数据库中搜索目的基因可能的生物学功能,或者特定的生物学功能有哪些基因可能参与。还可以到 Genecards 数据库去查询 感兴趣的基因的功能,Genecards http://www.genecards.org  .

生物信息学参考书:
1.DNA和蛋白质序列数据分析工具(第二版)PDF
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=6358121&fpage=1&target=blank
下载后即可阅读。
2.DNA和蛋白质序列数据分析工具_(第三版)
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=7614763&fpage=1&target=blank
下载后好像无法解压,楼主试试看吧,至少“DNA和蛋白质序列数据分析工具(第二版)”肯定能够用。
“DNA和蛋白质序列数据分析工具(第二版)”都是讲的生物信息学数据库和生物信息学软件的具体应用,很容易看懂并且自己上手操作,不过没有讲述各种算法的原理。

如果要更深入学习生物信息学,建议学习:
1.Pierre Baldi etal.,Bioinformatics------the Machine Learning Approach,MIT press,2001,千万不要看该书的翻译版本,翻译版烂的难以想象,翻译版就连条件概率的公式的含义都不知道怎么解释!下载:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1038227&fpage=1&target=blank
2.M.Zvelebil ,J.O.Baum 著(2008),李亦学、郝沛 主译,理解生物信息学,科学出版社,2012,这本书的英文原版,我还没有见过,此书内容丰富,解析详细,但是让人非常不爽的是全书所有的数据库和软件下载处均未在正文中给出具体网址,而是每章末的参考文献中给出带有具体网址的SCI文献。
3.李霞、李亦学 主编,生物信息学学习指导与习题集,人民卫生出版社,2011,现在大陆唯一的一本生物信息学习题解答,包括上机题目中不少也有文字版本的具体解答。
4.M.Michael Gromiha,Protein Bioinformatics:From Sequence to Function,Elsevier,2001.

就先说这些吧,意见仅供参考。
11楼2014-07-09 01:40:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

QQ894064647

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

我觉得看书啊,看文献都不如看视频来得快,人与人交流学东西最快乐,我找到个不错的生信资源。感兴趣的请进:https://shop119322454.taobao.com/
12楼2016-02-03 14:52:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 930111 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 268分085602化学工程调剂 +31 月照花林。 2026-04-09 31/1550 2026-04-12 23:37 by 学zh
[考研] 211本科材料化工求调剂 +16 YHLAH 2026-04-11 19/950 2026-04-12 22:43 by kyle12138
[考研] 307求调剂 +10 tzq94092 2026-04-10 10/500 2026-04-12 08:18 by wise999
[考研] 303求调剂 +14 SereinQ 2026-04-10 15/750 2026-04-11 20:43 by 蓝云思雨
[考研] 070300化学279求调剂 +19 哈哈哈^_^ 2026-04-08 20/1000 2026-04-11 20:43 by stoner78
[考研] 288求调剂,一志愿华南理工大学071005 +18 ioodiiij 2026-04-08 18/900 2026-04-11 20:25 by liyun12321
[考研] 085400 328分 求调剂 +10 喂你一个大橙子 2026-04-09 14/700 2026-04-11 19:53 by lqspecial
[考研] 283求调剂,工科! +12 苏打水7777 2026-04-08 12/600 2026-04-11 10:28 by 逆水乘风
[考研] 281求调剂 +11 觉得好的吧 2026-04-10 11/550 2026-04-11 09:35 by 逆水乘风
[考研] 346,工科0854求调剂,专硕 +7 moser233 2026-04-10 8/400 2026-04-11 08:52 by 猪会飞
[考研] 296求调剂 +6 汪!?! 2026-04-08 6/300 2026-04-10 11:02 by mattzhming
[考研] 材料专硕调剂 +16 哈哈哈吼吼吼哈 2026-04-07 17/850 2026-04-09 21:16 by wutongshun
[考研] 070300化学 求调剂 +13 73372112 2026-04-08 13/650 2026-04-09 20:22 by maddjdld
[考研] 调剂 +19 2261744733 2026-04-08 19/950 2026-04-09 19:11 by vgtyfty
[考研] 348求调剂 +3 candyyyi 2026-04-09 3/150 2026-04-09 17:20 by 段伟艳
[考研] 复试调剂,一志愿郑州大学材料与化工289分 +31 硕星赴 2026-04-08 31/1550 2026-04-09 16:54 by Delta2012
[考研] 生物学308分求调剂(一志愿华东师大) +13 相信必会光芒万 2026-04-06 16/800 2026-04-09 13:54 by 徐良白眉大侠
[考研] 336求调剂,一志愿中科大 +9 墨彧 yuyu 2026-04-06 9/450 2026-04-08 11:24 by 想读书的菌菌
[考研] 325 调剂 +6 QQ小虾 2026-04-07 6/300 2026-04-07 15:17 by Ccclqqq
[考研] 考研调剂 +3 Wwwwwww哇 2026-04-06 3/150 2026-04-06 20:55 by lbsjt
信息提示
请填处理意见