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liuchenhan新虫 (小有名气)
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有关create_atoms相关命令 已有1人参与
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本人脚本中先读结构文件nanonew.xyz，原子类型1-12，然后利用create_atoms命令生成一些其他原子，想安排这些原子的类型为13，但总是报错，请各位帮忙指导一下，实现我想要的功能，非常感谢。 units metal dimension 3 boundary s s s neighbor 2.0 nsq #force field ******************************************************* atom_style atomic read_data nanonew.xyz lattice custom 4.32 a1 1.0 0.0 0.0 a2 0.0 0.577350269 0.0 a3 0.0 0.0 1.0 basis 0.0 0.5 0.0 basis 0.3333333333333 0.5 0.0 basis 0.5 0.0 0.0 basis 0.83333333333 0.0 0.0 #lattice custom 3.52 a1 1.0 0.0 0.0 a2 0.0 0.577350269 0.0 a3 0.0 0.0 1.0 basis 0.0 0.0 0.0 region boxx block 0 3 0 3 0 2 #create_box 1 box create_atoms 13 region boxx mass 13 28.0 pair_style lj/cut 3.0 pair_coeff * * 0.024 3.4 velocity all create 300 58127640 mom yes rot yes dist gaussian units box #300K fix 3 all temp/berendsen 300 300 0.05 #set the T of mobile is 300K while the initial value is300K thermo_style custom step temp etotal vol #thermo_modify lost warn thermo 100 timestep 0.0005 dump id1 all custom 1000 dump.lammpstrj id type x y z compute mytempall all temp/com fix Tall all ave/time 1 100 100 c_mytempall file Tall.txt dump last all custom 40000 dump.last type x y z run 40000 报错信息如下： LAMMPS (14 May 2013) Reading data file ... orthogonal box = (-0.1 -0.1 -0.1) to (28.7 40.7 100) 1 by 1 by 1 MPI processor grid 240 atoms Lattice spacing in x,y,z = 4.32 2.49415 4.32 ERROR: Illegal create_atoms command (../create_atoms.cpp:109) |
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