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liufeng0619银虫 (正式写手)
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POSCAR合并问题 已有2人参与
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| 各位大牛，我准备用VASP做吸附，但是发现基底和吸附基团的结构不一样，也就是说分别建立POSCAR时，基底和吸附基团的POSCAR基矢不一样，在这种情况下，整体吸附模型的POSCAR怎么合并呢？晶格常数怎么办？其次，当基底和吸附基团分别进行优化后，整体吸附模型还需要再有优化吗？ |
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liufeng0619
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2楼2014-06-19 10:44:08
飞翔……
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3楼2014-06-19 12:21:58
liufeng0619
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4楼2014-06-19 12:49:50
【答案】应助回帖
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liufeng0619: 金币+10, ★★★很有帮助, 谢谢啦 2014-06-19 20:43:40
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liufeng0619: 金币+10, ★★★很有帮助, 谢谢啦 2014-06-19 20:43:40
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???O???? POSCAR ----------------------------------------------------------------- POSCAR A 1.000000 10.00000 0.0000 0.00000 0.00000 10.0000 0.00000 0.00000 0.0000 10.00000 A 2 Selective Dynamics Direct 0.00 0.00 0.00 T T T 0.10 0.10 0.10 T T T ----------------------------------------------------------------- POSCAR B 1.000000 15.00000 0.0000 0.00000 0.00000 15.0000 0.00000 0.00000 0.0000 15.00000 A 2 Selective Dynamics Direct 0.50 0.50 0.50 T T T 0.60 0.60 0.60 T T T ----------------------------------------------------------------- ??? POSCAR ?? lattice vectors ??? ???????? ?????????????~??????????λ~???? ??????? POSCAR B~ ??? ----------------------------------------------------------------- POSCAR B 1.000000 10.00000 0.0000 0.00000 0.00000 10.0000 0.00000 ??r???? lattice vector ??? 0.00000 0.0000 10.00000 A 2 Selective Dynamics Direct 0.50 0.50 0.50 T T T 0.65 0.65 0.65 T T T ???~?@?????????? ----------------------------------------------------------------- ??????p?????? ??t?? ???????????????? optimize |
5楼2014-06-19 17:13:47
liufeng0619
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6楼2014-06-19 20:43:28
7楼2014-06-19 21:14:18
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8楼2014-06-20 20:02:20
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9楼2014-06-20 20:17:11
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喔~ graphene 吸在表面上~~~嗯嗯 忘了還有這種可能 (薄膜吸附表面) 這也屬於我上面講的第三種 (就像是很薄很薄的表面吸到表面上) 也就是~ 比較麻煩處理的狀況 重點就是 要做一個 cell 能裝下 graphene ~ 也同時可以裝下 金屬表面 假設你計算的 graphene 最小 cell size 是 4x4x10 (這是我隨便給的，單位是 Angstrom，稱為 A) 假設你準備的金屬表面最小 cell size 是 5x5x10 (稱為 B) 那~你要同時裝 graphene 和 金屬表面的話 最簡單的做法就是~準備 20 A x 20 A x 10 A 的 cell (如此大的 cell 可以裝 4x4 倍大的 B 和 5x5 倍大的 A) 我猜~ 講到這~你應該可以理解我在講啥 這是 "最簡單" 的作法 但不見的是 "最正確" 的作法 因為 graphene 在表面上是可以"旋轉" 所以~~~合?銉烧叩姆椒ň涂梢杂泻芏嗪芏喾N可能了....... |
10楼2014-06-20 22:31:59